Vastus Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogu poolt esitatud küsimusele jätku taotlus e „ Vereplasmade süvauuring metaboliitide profiilide koostamiseks Eesti geenivaramu kohordis “ kohta. V astutava uurija Tõnu Esko poolt. Nõukogu arutas jätku taotlust 08.02.2022. a korralisel koosolekul. Nõukogu otsustas anda loa antud uuringu läbiviimiseks pärast vastutava uurija poolt järgmistele küsimustele selgituse saamist ning taotlusse täienduste tegemist: Küsimused: Palun kaasajastada andmekaitse osa vastavalt GDPR-i ja IkS-i uue redaktsiooni seadussätetele sh kirjeldada kaitsemeetmeid. Vastus: Kõik isikud on enne geenivaramuga liitumist allkirjastanud „Geenidoon oriks saamise nõusoleku vormi“ ( https://www.riigite ataja.ee/akt/13343233 ) . Geenidoonorite andmeid ei depseudonüümita ega nendega ühendust ei võeta, seega ei põhjusta antud uuring lisakoormust geenidoonoritele. Projekti raames edastatakse Nightingale Health Oy-le ainult geenidoonorite pseudonüümitud koeproovid koos geenidoonorile TÜ EGV poolt määratud koodiga. Koodivõti on ainult TÜ-l EGV vastutava töötlejana. Depseudonüümimist võimaldavaid andmeid ei edastata ning koeproovide saajal puudub võimalus ja faktiliselt on võimatu koeproovide ja nende analüüside tulemuste kokku viimine kindla füüsilise isikuga. Vastavalt inimgeeniu uringute seaduse (IGUS) ( https://www.riigiteataj a.ee/akt/113032019064 ) § 18 lõikele 4 võib TÜ EGV koeproove säilitada ja kasutada uuringuteks ka väljaspool Eesti Vabariigi territooriumi, kui selleks ilmnevad kaalukad põhjused. Kaalukaks põhjuseks praegusel juhul on taotluse punktis 5 kirjeldatud Nightingale Health Oy spetsiifiline andmeanalüüsi kompetents, mis TÜ-l EGV vastutava töötlejana täna puudub. Taotluses kirjeldatud koostöö loob võimaluse saavutada innovaatilisi teadustulemusi, muuhulgas leida seoseid metaboliitide väärtuste ning terviseandmestike vahel, luua kliinilisi riskiskoore ja teha teadusavastusi, mida oleks võimalik rakendada personaalmeditsiinis. Koeproovid väljastatakse vastavalt IGUS § 20 lg 1 ja § 22 lg 4 nõuetele pseudonüümituna ja hulgana, mis tähendab, et Nightingale Health Oy ei saa geenidoonorite isikuid tuvastada ega koeproove ning nende analüüsimise tulemusel saadavaid andmeid konkreetse füüsilise isikuga kokku viia. Koeproovid väljastatakse kooskõlas IGUS § 20 ja Sotsiaalministri määrusega ,,Geenidoonori koeproovi, DNA kirjelduse ja terviseseisundi kirjelduse väljastamise korraga" ( https://www.riigiteataj a.ee/akt/112032019045 ) proovide saajaga sõlmitava lepingu alusel. Koeproovide väljastamisel viib TÜ EGV läbi kontrolli ja veendub, et koeproovide saaja täidab kõik Tervise- ja tööministri määruses "Geenivaramu volitatud töötlejale esitatavad nõuded" ( https://www.riigiteataja.ee/akt/112032019027 ) kehtestatud tingimused seoses koeproovide säilitamisega. Vastavalt IGUS § 12 lõikele 1 ja § 15 lõikele 1 kasutab TÜ EGV geenidoonorite koeproove ja vastavalt EL isikuandmete kaitse üldmääruse (2016/679) (IKÜM) artiklitele 6(1)(a) ja 9(2)(a) töötleb geenidoonorite andmeid geenidoonori poolt antud nõusoleku alusel. Praeguse projekti puhul on ainsad andmed, mis koos koeproovidega edastatakse, koodid, mille TÜ EGV on kooskõlas IGUS §-s 23 sätestatuga igale geenidoonorile ja nende koeproovidele määranud. Koodivõti on ainult TÜ-l EGV vastutava töötlejana. Nightingale Health Oy jaoks on saadavad andmed (st nii edastatav kood kui koeproovide analüüside tulemusel saadavad andmed) anonüümsed. Nightingale Health Oy -l pole võimalik neid konkreetse füüsilise isikuga kokku viia (IKÜM põhjenduspunkt 26). Vastavalt IGUS-ses sätestatule rakendatakse IKÜM artikli 89(1) mõttes kaitsemeetmena pseudonüümimist . Koeproovid väljastatakse pseudonüümitud kujul, mistõttu nende analüüsimisest saadavad andmed on samuti pseudonüümitud ning Nightingale Health Oy jaoks anonüümsed. Nigthingale Health Oy -l puudub võimalus andmete depseudonüümimiseks . Edastatakse vereplasmat, mis ei sisalda DNA-d. See tähendab, et füüsilise isiku tuvastamine oleks eluliselt täiesti välistatud. Täiendavate kaitsemeetmetena on Nightingaly Oy-le väljastatud kvaliteedijuhtimise sertifikaat EN ISO 13485:2016 ning nende labor on Soomes akrediteeritud (standard SFS-EN ISO/IEC 17025). Isikuandmete kaitse seadus (IKS) ( https://www.riigiteataja.ee/akt/104012019011 ) ei reguleeri isikuandmete töötlemist teadusuuringu eesmärgil isiku nõusoleku alusel. IKS § 6 reguleerib ainult isikuandmete töötlemist teadusuuringu eesmärgil ilma isiku nõusolekuta , mistõttu tuleb lähtuda IKÜM-s ja IGUS-s sätestatust. Vastus on põhitaotlusesse eristuvalt märgituna sisse viidud. Lisame Nightingaly Oy-le väljastatud kvaliteedijuhtimise sertifikaadi. Lugupidamisega Tõnu Esko Vastutav uurija /allkirjastatud digitaalselt/
LB-0428 12/2021
QUALITY AT NIGHTINGALE HEALTH
Nightingale Health is committed to achieving high quality in manufacturing of medical devices and in
providing medical laboratory services. Quality and compliance with all applicable regulatory and
customer requirements underline all our efforts.
“Nightingale Health is committed to producing and marketing reliable, and effective solutions
for analyzing biofluids. We will continually follow, review and enhance our Quality
Management System to fulfil all relevant regulatory requirements and ensure the
effectiveness and impartiality of our operations.”
CERTIFIED QUALITY MANAGEMENT SYSTEM
Nightingale Health operates under certified quality management system in accordance with EN ISO
13485:2016 (certified by DEKRA Certification B.V.).
ACCREDITED LABORATORY
Nightingale's laboratory is an accredited testing laboratory. The Nightingale Health Plc. laboratory
T333 is accredited by the FINAS Finnish Accreditation Service, accreditation criteria SFS-EN ISO/IEC
17025. Scope of accreditation for clinical services and sites are available at www.finas.fi.
CE-MARKED TECHNOLOGY
Nightingale Health measures all blood samples with a CE-marked IVD device.
HEALTHCARE QUALITY
Procedures for clinical laboratory tests are based on standard for medical laboratories (EN ISO 15189).
Clinical laboratory tests are calibrated to standard materials provided by National Institute of Standards
and Technology (NIST). Method validation is done according to CLIA’s US FDA recognized consensus
standards.
1/2
LB-0428 12/2021
TESTING LABORATORY FOR ACADEMIA
Nightingale Health measures all blood samples with a CE-marked IVD device. In addition to that, blood
analysis services are performed according to standard operating procedures and work instructions
that are a part of Nightingale Health`s certified Quality Management System.
INTERNAL QUALITY ASSURANCE
All processes related to sample analysis are performed according to controlled standard operating
procedures and work instructions. Full traceability for sample handling is available through our
Laboratory Information Management System.
Laboratory has adapted multiple actions, such as maintenance and testing of the laboratory
instruments, management of reagents, control of purchasing and regular monitoring of the laboratory’s
performance through quality control samples, that allow us to provide high-quality services.
EXTERNAL QUALITY ASSURANCE
Nightingale Health participates in UK NEQAS, WEQAS and Labquality external quality assurance
(EQA) programs to monitor its measurement quality between Nightingale and other laboratories.
Nightingale Health Plc. | nightingalehealth.com
2/2
UURIMISTÖÖ AVALDUS KOOSKÕLASTUSE SAAMISEKS TARTU ÜLIKOOLI INIMUURINGUTE EETIKA KOMITEELT 1. UURI MISTÖÖ ANDMED Uuri mistöö täielik nimetus: Vereplasmade süva uuring metaboliitide profiilide koostamiseks Eesti g eenivaramu kohordis Uur i mistöö toimumiskoht : Eesti, Tartu ja Soome, Helsingi 2. UURIMISTÖÖ TEOSTAJAD JA UURINGUKESKUSED 2.1. Vastutav uurija Tõnu Esko , PhD Tartu Ülikooli genoomika instituut asedirektor, inimese ge noomika professor Riia 23b, Tartu 51010 t el. 737 4028 e -post:
[email protected] allkiri: 2.2. Kaastöötajad Toomas Haller, PhD Tartu Ülikooli genoomika instituut, Eesti geenivaramu teaduskeskus Genoomika-metaboloomika kaasprofessor Riia 23b, Tartu 51010 tel. 737 4041 e-post:
[email protected] allkiri: Krista Fischer, PhD Tartu Ülikooli genoomika instituut, Eesti geenivaramu teaduskeskus Biostatistika kaasprofessor Riia 23b, Tartu 51010 tel. 737 4041 e-post:
[email protected] allkiri: Nele Taba Tartu Ülikooli genoomika instituut, Eesti geenivaramu Funktsionaalse genoomika spetsialist Riia 23b, Tartu 51010 Tel: +372 5162071 e-post:
[email protected] Oliver Aasmets , MSc Tartu Ülikooli genoomika instituut S petsialist Riia 23b, Tartu 51010 T el : 7 374039 e-post:
[email protected] Elin Org , PhD Tartu Ülikooli genoomika instituut G enoomika-mikrobioomika kaasprofessor Riia 23b/2-504 Tel : + 372 737 4034 e-post:
[email protected] Heli Julkunen, Data Scientist Nightingale Health O y , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358407078780 Valtteri Mäkelä , Senior Data Scientist Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] , +358 40 637 8851 Jeffrey Barrett , Data Scientist Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358 44 235 3461 Lauri Ahonen: Senior Data Scientist Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358438240302 Jussi Nokso-Koivisto, Analytics Architect Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358504337256 Juri Meskanen, DevOps Engineer Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358505177300 Kristian Nybo Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358 50 531 4970 Antti Kangas Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358 50 361 7056 Toni Vanhala Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358 41 528 2477 Henrik Aalto Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00300 Helsinki, Soome
[email protected] +358 50 356 3737 Peter Würtz Nightingale Health Oy , Soome Mannerheimintie 164a 00350 Helsinki, Soome tel. 358-504670900 e-post
[email protected] allkiri: 2.3.Vastutava uurija asutuse juhataja või tema kohusetäitja on uurimistöö korraldamisega nõus: Andres Metspalu MD, PhD Tart u Ülikooli genoomika instituut Geenivaramu juhataja Riia 23b, Tartu 51010 tel. 7375 066 e-post:
[email protected] allkiri : 2.4. Uurimistöösse kaasatud muu asutuse kooskõlastus: volitatud isiku ees- ja perekonnanimi: Teemu Suna amet: Tegevjuht töökoht: Nightingale Health Oy , Soome töökoha aadress: Mannerheimintie 164a, 00350 Helsinki, Soome allkiri: 3. UURIMISTÖÖ FINANTSEERIMINE A llikas : Ettevõtlus koostöö (leping allkirjastatud 4. veebruar 20 21 ) Finantsallika hoidja : Tõnu Esko, TÜ GI asedirektor U urimistöö üldmaksumus , sh töötasude jaotus uuringu teostajatele : planeeritava lepingu üld maht on 1. 75 M€ ning k ehtivusaeg 7 aastat allkirjastamisest. Eelarvest enamus on Nightingale Health Oy asutuse sisene investeering (eksperiment, tööjõud, arvutusjõudlus) ning 13 0,000 € on planeeritud Eesti geenivaramu kulude katteks (tööjõud, andmebaaside toetustugi). U uritavatele kompensatsiooni maksmine: uuritavatele kompensatsiooni ei maksta . 4. LÜHIÜLEVAADE SIIANI SAMAL TEEMAL LÄBIVIIDUD UURIMISTÖÖD EST Veri on enimlevinud kude uurimaks inimese tervislikku seisundit kerge kättesaadavuse ja su ure informatiivsuse tõttu. Vere plasmas sisalduvad molekulid annavad operatiivset informatsiooni organismi seisundi kohta. Verest mõõdetud parameet rid moodustavad nn intermediaalse fenotüübi. See tase on oluline ühendamaks geneetilist taset makrofenotüüpide (nagu näiteks spetsiifilised haigused) tasemega. Ülegenoomsed assotsiatsiooniuuringud on tõestanud intermediaalsete fenotüüpide suurt väärtust (Kettunen et al Nat Commun. 2016 ) . Genoomseid järjestusi ja intermediaalseid fenotüüpe saab määrata väga täpselt – tulemuseks on andmestik, mis võimaldab saada vastuseid uudsetele meditsiinivaldkonna küsimustele . 5. KAVANDATAVA UURIMISTÖÖ EESMÄRK, KOKKUVÕTE JA PÕHJENDUS TÜ Eesti g eenivaramu on kogunud vereplasma proove 2021 aasta seisuga 20 7 000 indiviidilt . Nendest üle 10 000 on juba analüüsitud tuumamagnetresonants (TMR) meetodil (koostöös Helsinki Ülikooliga [eetikaluba 186T-12, istung 26.10.2009) . Tulemused on olnud aluseks paljudele uuringutele, mis on viinud oluliste publikatsioonideni ning meditsiinis kasutatavate avastusteni. Nii on näiteks uuritud TMR-biomarkerite geneetilist tausta ( Kettunen et al. 2016 ) ning väga olulise avastusena on leitud nelja mark eri oluline seos üld- ja põhjus spetsiifilise suremusega (Fischer et al., 2014), samuti on uuritud soo-spetsiifilisi vanusega seotud muutusi TMR-parameetrites ( Auro, K., Joensuu, A., Fischer. K. et al 2014 ) ning seoseid erinevate haigustega ( van der Lee et al., 2018, Tynkkynen et al. 2018 ) . Väga oluline on ka fakt, et TMR-meetodil saab määrata erinevate verelipiidide taset (LDL- ja HDL-kolesterool, triglütse riidid, jne) – hetkel on käimas mitu teadusprojekti, kus kasutatakse just TMR-meetodil määratud näitajaid kardiovaskulaarhaiguste riski hindamisel , sh ka geneetiliste skoorid e lisandväärtus võrreldes tradi tsiooniliste meetoditega (nn Framinghami riskiskoor) . Ligipääs andmetele ettevõttele Nightingale Health Oy tehakse teadusarenduskoostöö eesmärgil, kuna ettevõttel on vastavate andmete spetsiifiline andmeanalüüsi kompetents, mis koostöös geenivaramu teadlastega võimaldab saavutada innovaatilisi teadustulemusi, muuhulgas leida seoseid metaboliitide väärtuste ning terviseandmestike vahel, luua kliinilisi riskiskoore ja teha teadusavastusi, mida oleks võimalik rakendada personaalmeditsiinis. Et senised uuringud on näida n ud TMR-meetodil määratud biomarkerite olulist prognostilist väärtust nii erinevate haiguste kui ka suremuse riski hindamisel, on vajalik välja töötada ka praktikas kasutatavad prognostilised mudelid. Selleks jääb aga olemasolev valimisuurus veel ebapiisavaks ja seetõttu oleks vajalik uurida TMR-meetodil ka ülejäänud isikute plasma proovid . Saadud tulemused võimaldaks välja töötada Eesti-spetsiifilise algoritmi südame isheemiatõve ja kardiovaskulaarsuremuse riski hindamiseks ja seega ka senisest tõhusamaks ennetustööks . Lisaks saaks uurida täiendavalt TMR-biomarkerite võimalikku rolli ka teiste levinud haiguste riski ja varase avast am isel . TÜ Eesti g eenivaramu s on käimas ka projekt, et uurida toitumise mõju metaboolsele profiilile. Esialgsed tulemused olemasolevate andmetega on huvitavad, viidates eri toitumismustritega inimeste väga suurtele erinevustele metaboolses profiilis. Uurimaks veelgi täpsemalt nii toitumise seoseid metaboolse profiiliga kui ka kaugemaid mõjusid tervisenäitajatele (haiguseriskid ja suremus), on ka siin vajalik valimimahu suurendamine nende osas, kellel on olemas TMR-meetodil määratud metaboolse d biomarkerid. Lisaks võimaldaks suurem valim hinnata toitumise põhjuslikke mõjusid terviseriskidele ja seda, kuivõrd on need mõjud vahendatud metaboolsete näitajate kaudu, kasutades nn Mendeli randomiseerimise meetodit. Eestis TMR-meetodil metaboliitide määramise võ imekus puudub. Seetõttu on kavas teostada analüüs koostöös Soome ettevõttega Nightingale Health Oy ( Kuopio ning Helsinki Ülikooli spinn-off firma ) , sealjuures finantseeritakse ka uuring täis mahus ettevõtte pool t . Kõik analüüsid viiakse läbi pseudonümiseeritud andmetega. Vere plasma uurimiseks kohordi tasemel kasutatakse põhiliselt mass-spektromeetriat ja TMR-meetodit . Nende erinevus e d on tehnilised. T ulemused erinevad põhiliselt selle poolest, milliseid molekule on võimalik määrata. Antud juhul eelista b Eesti geenivaramu TMR-meetodit , kuna see a) on oma teaduslikku väärtust tõestanud, b) on finantsiliselt võimalik (kuni 5x odavam kui mass-spektromeetria ) , c) ühildub hästi olemasolevate geenivaramu andmemassiividega . TMR-tehnoloogia võimaldab hetkel määrata kuni 240 molekuli suhtelise kontsentratsiooni uuritavas bioloogilises materjalis. Uuritava plasma kogus ühe proovi kohta on alla 100 uL. Antud taotluse eesmärk on saada kooskõlastus Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogult kõikide geenidoonorite plasma proovid e väljastamiseks ( 21.01.2022 seisuga 207 000, samas aga on uute geenidoonorite kogumine jätkuv protsess ja geenidoonorite kogu arv võib ajas suureneda ) ning lisas 1 1.2 toodud terviseandmetele ligipääsu tekitamiseks TÜ Teadusarvutus keskuse serveril ettevõttele Nightingale Health Oy , Helsinki, Soome . Ühe geenidoonori kohta soovime väljastada kuni 100 mikroliitrit vere plasmat. Kooskõlastuse saamise järgselt on kavas esitada jätku taotlus uuendatud loa saamiseks Tartu Ülikooli senatile koeproovide väljastamiseks välismaale. 6. UURIMISTÖÖ T EOSTAMISE AEG Algus: mai 2018 Lõpp: detsember 20 2 7 7. UURITAVATE JA NENDE VÄRBAMISVIISI TÄPNE KIRJELDUS Verep lasma on kogutud, eraldatud ning hoiustatud juba eelneva värbamisprotsessi käigus. Esimeses faasis analüüsitakse nende geenidoonorite plasmad, kel lel eelnevalt puuduvad TMR-tehnoloogial põhinevad metaboloomika profiilid. TÜ Geenivaramu on huvitatud teostama TMR-meetodil põhineva metaboloom ika profileerimise kõigile geenidoonori tele. Uusi geenidoonoreid spetsiifiliselt selle käesoleva uurimistöö läbiviimiseks ei kaasata. Geenidoonorite tagasikodeerimist ei toimu. 8. UURIMISMETOODIKA TÄPNE KIRJELDUS Plasma analüüs teostatakse Soomes, Helsing i firmas Nightingale Health Oy . Andmeanalüüs teostatakse teadusliku koostöö raames Eesti ja Soome teadlaste vahel. TMR-meetodiga loodavate metaboliitide profiilide kvaliteedianalüüs, normaliseerimine ning struktureerimine teostatakse Nightingale Health meeskonna poolt ning tekkiv andmebaas integreeritakse Eesti geenivaramu infobaasidesse . Uuringusse kaasatakse üksnes pseudo n ümiseeritud andmed, sh teistest andmekogudest saadud terviseandmed. T erviseandmete (haiglate andmed, riiklike andmekogude andmed) analüüs teostatakse Tartu Ülikooli arvutuspilves, kuhu Nightingale Health Oy meeskonnale luuakse kontod (kuid mitte õigus andmeid kopeerida), vastavalt seadusele ning Tartu Üliko oli andmeturvalisuse eeskirjadele ja regulatsioonidele. Terviseandmeid puudutavad analüüsid tehakse Tartu Ülikooli arvutuskeskuse serveris , kuhu Eesti geenivaramu teadlastele ja Nigthingale Health Oy töötajatele luuakse kontod ja ligipääs, vastavalt seadusele ning Tartu Üliko oli andmeturvalisuse eeskirjadele ja regulatsioonid e le. Andmeturvalisus on selgelt reguleeritud, kontrollitud ja tagatud vastavalt Tartu Ülikooli ning Ni ghtingale Health Oy lepingule . 9. UURIMISTÖÖ EETILISTE ASPEKTIDE KIRJELDUS Kõik isikud on enne geenivaramuga liitumist allkirjastanud „Geenidoonoriks saamise nõusoleku vormi“ (https://www.riigiteataja.ee/akt/13343233). Geenidoonorite andmeid ei depseudonüümita ega nendega ühendust ei võeta, seega ei põhjusta antud uuring lisakoormust geenidoonoritele. Projekti raames edastatakse Nightingale Health Oy-le ainult geenidoonorite pseudonüümitud koeproovid koos geenidoonorile TÜ EGV poolt määratud koodiga . Koodivõti on ainult TÜ-l EGV vastutava töötlejana . Depseudonüümimist võimaldavaid andmeid ei edastata ning koeproovide saajal puudub võimalus ja faktiliselt on võimatu koeproovide ja nende analüüside tulemuste kokku viimi ne kindla füüsilise isikuga. Vastaval t i nimgeeniuuringute seaduse (IG US ) ( https://www.riigiteataja.ee/akt/113032019064 ) § 18 l õikele 4 võib TÜ EGV koeproove säilitada ja kasutada uuringuteks ka väljaspool Eesti Vabariigi territooriumi , kui selleks ilmnevad kaalukad põhjused . Kaalukaks põhjuseks praegusel juhul on taotluse punktis 5 kirjeldatud Nightingale Health Oy spetsiifiline andmeanalüüsi kompetents, mis TÜ-l EGV vastutava töötlejana täna puudub. Taotluses kirjeldatud koostöö loob võimaluse saavutada innovaatilisi teadustulemusi, muuhulgas leida seoseid metaboliitide väärtuste ning terviseandmestike vahel, luua kliinilisi riskiskoore ja teha teadusavastusi, mida oleks võimalik rakendada personaalmeditsiinis. Koeproovid vä ljastatakse vastavalt IG US § 20 lg 1 ja § 22 lg 4 nõuetele pseudonüümituna ja hulgana, mis tähendab, et Nightingale Health Oy ei saa geenidoonorite isikuid tuvastada ega koeproove ega nende analüüsimise tulemusel saadavaid andmeid konkreetse füüsilise isikuga kokku viia . Koeproovid väljastatakse kooskõlas IGUS § 20 ja Sotsiaalministri määrusega ,,Geenidoonori koeproovi, DNA kirjelduse ja terviseseisundi kirjelduse väljastamise korraga" (https://www.riigiteataja.ee/akt/112032019045) proovide saajaga sõlmitava lepingu alusel. Koeproovide väljastamisel viib TÜ EGV läbi kontrolli ja veendub, et koeproovide saaja täidab kõik Tervise- ja tööministri määruses "Geenivaramu volitatud töötlejale esitatavad nõuded" (https://www.riigiteataja.ee/akt/112032019027) kehtestatud tingimused seoses koeproovide säilitamisega. Vastavalt IGUS § 12 lõikele 1 ja § 15 lõikele 1 kasutab TÜ EGV geenidoonorite koeproove ja v astavalt EL isikuandmete kaitse üldmääruse (2016/679) (IKÜM) artiklitele 6(1)(a) ja 9(2)(a) töötleb geenidoonorite andmeid geenidoonori poolt antud nõusoleku alusel. Praeguse projekti puhul on ainsad andmed, mis koos koeproovidega edastatakse, koodid, mille TÜ EGV on kooskõlas IGUS §-s 23 sätestatuga igale geenidoonorile ja nende koeproovidele määranud. Koodivõti on ainult TÜ-l EGV vastutava töötlejana. Nightingale Health Oy jaoks on saadavad andmed (st nii edastatav kood kui koeproovide analüüside tulemusel saadavad andmed) anonüümsed. Nightingale Health Oy-l pole võimalik neid konkreetse füüsilise isikuga kokku viia (IKÜM põhjenduspunkt 26). Vastavalt IGUS-ses sätestatule rakendatakse IKÜM artikli 89(1) mõttes kaitsemeetmena pseudonüümimist. Koeproovid väljastatakse pseudonüümitud kujul , mistõttu nende analüüsimisest saadavad andmed on samuti pseudonüümitud ning Nightingale Health Oy jaoks anonüümsed. Nigthingale Health Oy-l puudub võimalus andmete depseudonüümimiseks . Edastatakse vereplasmat, mis ei sisalda DNA-d. See tähendab, et füüsilise isiku tuvastamine oleks eluliselt täiesti välistatud. Täiendavate kaitsemeetmetena on Nightingaly Oy-le väljastatud kvaliteedijuhtimise sertifikaat EN ISO 13485:2016 ning nende labor on Soomes akrediteeritud (standard SFS-EN ISO/IEC 17025). Isikuandmete kaitse seadus (IKS) ( https://www.riigiteataja.ee/akt/104012019011 ) ei reguleeri isikuandmete töötlemist teadusuuringu eesmärgil isiku nõusoleku alus el. IKS § 6 reguleerib ainult isikuandmete töötlemist teadusuuringu eesmärgil ilma isiku nõusolekuta , mistõttu tuleb lähtuda IKÜM-s ja IGUS-s sätestatust. TÜ EGV on erinevate uuringute, sealhulgas ,,ENGAGE – European Network for Genetic and Genomic Epidemiology ” (luba 186T-12; 26.10.2009), ,,Geneetilise varieeruvuse mõju hindamine inimese isiksusele ja kronotüübile ” , ” Geenivaramu doonorite tagasikodeerimine lisaküsimustike täitmiseks ” (luba 170/T-38, 28.04.2008), ,,Geneetiline varieeruvus, elustiil ja keskkonnategurid kui peamised tervise mõjurid ” (luba 166/T-21, 17.12.2007) ning ,,Genoomsete ümberkorralduste mõju geeniekspressioonile ja indiviidi fenotüübile ” (luba 196/T-11, 20.09.2010), raames koeproove väljastanud Inglismaale, Saksamaale, Hispaaniasse ning Soome (luba nr. 160/10, 21.05.2007) . Laiamahuline väljastus "Südame-veresoonkonnahaiguste diagnoosimist täpsustavate biomarkerite identifitseerimine ja valideerimine Euroopa vananevas populatsioonis" alaprojekt "Muude haiguste toime südamepuudulikkuse metaboolsetele markeritele" 10le Euroopa institutsioonile ( 228/T-13, 17.09.2013 ja 267/T-13, 20.02.2017). Erasektorile on antud kooskõlastus mitmetele bi oloogiliste proovide uuringutele nagu Olink Proteomics [Rootsi] ("Geenivaramu molekulaarse andmekogu täiendamine-valguprofiilide mõõtmine kuni 5000 geenidoonori plasma proovis" 262/T-3, 1.10.2016), Nestle Health Inc [Šveitsi] ("Geneetiliste variantide ning ainevahetusproduktide analüüs leidmaks inimese kaalutõusu pärssivaid faktoreid" 229/T-6 , 3.10.2013 ja pikendatud 8.06.2017 ) , Cambridge Protein Arrays Ltd [UK] ( "Lisataotlus uue uuringu keskuse Cambridge Protein Arrays Ltd ja Babraham Institute lisamiseks BBMRI-LPC uuringu raames plasmade edastamiseks." 253/M-20, 16.11.2015 ) ja Broad Institute Inc [USA] ("Eesti g eenivaramu geenidoonorite täisgenoomse järjestuse kirjeldamine ning geneetiliste variantide seoses haiguste, elustiili ja käitumisega" (250/M-26), 2.01.2014 ja pikendatud 31.12.2020) . Uuringu kasud: Eesti populatsioonist pärit plasmaproovide anal üüs kirjeldatud projektis täiendab oluliselt TÜ EGV geenidoonorite molekulaarsete fenotüüpide andmebaasi. Loodav metaboloomika profiilide andmebaas on maailmas unikaalne , kuna oleks suurim ühtsest biopangast loodud andmekogu, mille osalejate terviseandmed on nii põhjalikult kirjeldatud (Geenivaramus kuni 20 aastat tagasiulatuvalt mitmetest andmebaasi de st). Loodav andmestik aitab tugevalt kaasa personaalmeditsiini rakendamisele Eesti tervishoiusüsteemi s . Kuna geenidoonoriks hakkamise faasis ei teostatud uuritavatele täisvere kliinilist iseloomustus t , siis puudub geenivaramu andmebaasis informatsioon mitmete oluliste kliiniliste riskitegurite kohta (nagu n äiteks kolesterool, veresuhkur jne). Sellised andmed on kättesaadavad üksnes haiglate terviselugudest, kuid vaid väike sel osa l geenidoonorite st on see informats ioon olemas. Taoline andmete lünklikkus piirab oluliselt kliiniliste otsusetugede ning uute ennetuste gevust võimaldavate algoritmide v älja töötamist (nii neid, mis põhinevad traditsioonilistel kliinilistel riskifaktoritel kui ka neid , kuhu on kaasatud geneetilised profiilid ning põhjalikud veremetaboliitide profiilid). Seda Eesti terviseandmebaaside puudust (lünklikud ning mittetäielikud andmed) nin g eTervise tüsilikku andmemudelit on välja toonud nii Sotsiaalministeeriumi ministrid ja kantslerid kui ka Eesti IT valdkonna juhtivad eksperdid. Kõik uuringus saadud andmed säilitatakse TÜ EGV andmebaasides. 10. TEAVE SAMA PROJE K TI VARASEMATEST VÕI SAMAAEGSETEST HINDAMISTEST VÕI KOOSKÕLASTAMISTEST MUJAL Ei ole varem hinnatud. 11 . LISAD: 11 .1 Uuringu läbiviija(te) CV(d) 11.2 Geenivaramu andmestik I Koostöö raames tehakse TÜ Geenivaramu poolt ligipääs TÜ Teadus arvutuskeskuse serveril jägnevale andmestikule : Basic characteristics: age, sex, nationality, ethnicity, measures of socioeconomic status Objective data: anthropometric measures, blood pressure, heart rate, smoking status, alchool use, fasting duration since blood draw, other clinical chemistry measures as available from baseline blood samples (including cholesterol measures, triglycerides, glucose and creatinine). Data on clinical chemistry measures from medical records, in particular for cholesterol measures, triglycerides, glucose and creatinine. Medication information at time of blood draw, including use of lipid-lowering medication, blood pressure lowering medication, proton pump inhibitors, antidiabetic medication, hormonal contraceptives, hormonal replacement therapy, antidepressant medication, use of fish oil and other supplements as available. Prevalent and incident diseases coded in ICD10 system ( extracted from National Health Insurance records, Hospital EHR, cancer registry, nationwide health records ). Disease code (4 digits accuracy) and disease diagnosis dates. Updated annually (or as carried out by Estonian Biobank). Mortality status, cause of death and date of death. Updated annually (or as carried out by Estonian Biobank). Viited: Fischer, K .; Kettunen, J.; Würtz, P .; Haller, T.; Aki S. Havulinna, A.S.; Kangas, A.J.; Soininen, P.; Esko, T .; Tammesoo, M-L.; Mägi, R.; Smit, S.; Palotie, A.; SRipatti, S.; Veikko Salmaa, V.; Ala-Korpela, M.; Perola, M.; Metspalu, A . (2014). Biomarker Profiling by Nuclear Magnetic Resonance Spectroscopy for the Prediction of All-Cause Mortality: An Observational Study of 17,345 Persons . PLOS Medicine , 11 (2), e1001606.10.1371/journal.pmed.1001606. Auro, K; Joensuu, A; Fischer , K; Kettunen, J; Salo, P; Mattsson, H; Niironen, M; Kaprio, J; Eriksson, JG; Lehtimaki, T; Raitakari, O; Jula, A; Tiitinen, A; Jauhiainen, M; Soininen, P; Kangas, AJ; Kahonen, M; Havulinna, AS; Ala-Korpela, M; Salomaa, V ... Perola, M. (2014). A metabolic view on menopause and ageing. Nature Communications , 5 (4708), 1−11.10.1016/j.jaci.2014.06.028. Kettunen J, Demirkan A, Würtz P, Draisma HH, Haller T , Rawal R, Vaarhorst A, Kangas AJ, Lyytikäinen LP, Pirinen M, Pool R, Sarin AP, Soininen P, Tukiainen T, Wang Q, Tiainen M, Tynkkynen T, Amin N, Zeller T, Beekman M, Deelen J, van Dijk KW, Esko T, Hottenga JJ, van Leeuwen EM, Lehtimäki T, Mihailov E, Rose RJ, de Craen AJ, Gieger C, Kähönen M, Perola M, Blankenberg S, Savolainen MJ, Verhoeven A, Viikari J, Willemsen G, Boomsma DI, van Duijn CM, Eriksson J, Jula A, Järvelin MR, Kaprio J, Metspalu A , Raitakari O, Salomaa V, Slagboom PE, Waldenberger M, Ripatti S, Ala-Korpela M. (2016) Genome-wide study for circulating metabolites identifies 62 loci and reveals novel systemic effects of LPA. Nature Communications , 7(11122), doi: 10.1038/ncomms11122. van der Lee SJ, Teunissen CE, Pool R, Shipley MJ, Teumer A, Chouraki V, Melo van Lent D, Tynkkynen J, Fischer K , Hernesniemi J, Haller T , Singh-Manoux A, Verhoeven A, Willemsen G, de Leeuw FA, Wagner H, van Dongen J, Hertel J, Budde K, Willems van Dijk K, Weinhold L, Ikram MA, Pietzner M, Perola M, Wagner M, Friedrich N, Slagboom PE, Scheltens P, Yang Q, Gertzen RE, Egert S, Li S, Hankemeier T, van Beijsterveldt CEM, Vasan RS, Maier W, Peeters CFW, Jörgen Grabe H, Ramirez A, Seshadri S, Metspalu A , Kivimäki M, Salomaa V , Demirkan A, Boomsma DI, van der Flier WM, Amin N, van Duijn CM.(2018) Circulating metabolites and general cognitive ability and dementia: Evidence from 11 cohort studies. Alzheimers Dement. Feb 28 . pii: S1552-5260(18)30020-7. doi: 10.1016/j.jalz.2018.01.003. [Epub ahead of print] Tynkkynen J, Chouraki V, van der Lee SJ, Hernesniemi J, Yang Q, Li S, Beiser A, Larson MG, Sääksjärvi K, Shipley MJ, Singh-Manoux A, Gerszten RE, Wang TJ, Havulinna AS, Würtz P, Fischer K , Demirkan A, Ikram MA, Amin N, Lehtimäki T, Kähönen M, Perola M, Metspalu A , Kangas AJ, Soininen P, Ala-Korpela M, Vasan RS, Kivimäki M, van Duijn CM, Seshadri S, Salomaa V. (2018) Association of branched-chain amino acids and other circulating metabolites with risk of incident dementia and Alzheimer's disease: A prospective study in eight cohorts. Alzheimers Dement . Jan 6. pii: S1552-5260(17)33855-4. doi: 10.1016/j.jalz.2017.11.012. [Epub ahead of print]
Saatja: Tartu Ülikool <
[email protected]>
Saadetud: 02.03.2022 08:55
Adressaat: SM Info <
[email protected]>
Teema: Vastused EBINi küsimustele uurimistöö "Vereplasmade süvauuring
metaboliitide profiilide koostamiseks Eesti geenivaramu kohordis" kohta
TereEsitame vastused EBINi küsimustele uurimistöö "Vereplasmade
süvauuring metaboliitide profiilide koostamiseks Eesti geenivaramu
kohordis" kohta.Teiega on jagatud Webdesktop-i dokumenti, mis asub
järgneval aadressil: LugupidamisegaEne Mö
[email protected] 1174