Protokoll

-864235 -144145 0 0 Tervise infosüsteemi andmevaramu (Health Sense ) projekti KOOSOLEKU PROTOKOLL Tallinn delta_beginDate \* MERGEFORMAT 24.05.2022 Algus kell 14.00 Lõpp kell 15.30 Juhatas: Kristjan Kolde Protokollis: Aivi Saar Võtsid osa: Kristiina Hunt, Silja Elunurm, Kadri Haller - Kikkatalo , Ruth Mägi, Allan Lepik, Mari Teesalu, Martin Ärm, Sulev Reisberg, Margit Laurits Männiste, Liis Hamburg, Anneli Laansoo, Laura Breede, Gunnar Piho Puudus(id): Eleri Lapp, Karl-Henrik Peterson, Martin Sepp, Piret Hirv, Pille Kink PÄEVAKORD: 1. Projekti hetkeseis, IV perioodi tegevused ja edasised plaanid (TEHIK) 2. Projekti IV perioodi tegevused ja edasised plaanid (TÜ) 3. Projekti IV perioodi tegevused ja edasised plaanid ( TalTech ) 4. Ettepanek projektilepingu muudatuseks (TEHIK) 5. Küsimused ja arutelu, muud teemad 1. Projekti hetkeseisu, IV perioodi tegevuste ja edasiste plaanide tutvustus KUULATI: Martin Ärm, Margit Laurits Männiste – IV perioodi tegevuste ülevaade Kristjan Kolde – projekti hetkeseisu ja edasiste plaanide tutvustus OTSUSTATI: 1.1 Võtta informatsioon teadmiseks 2. Projekti IV perioodi tegevuste tutvustus, obfuskeerija demo KUULATI: Sulev Reisberg – ülevaade IV perioodi tegevustest, obfuskeerija demo OTSUSTATI: 2.1 Võtta informatsioon teadmiseks. 2.2 Tartu Ülikool loob lisaks eestikeelsele obfuskeerija demole ka ingliskeelse demovideo. 3 . Projekti IV perioodi tegevuste ja edasiste plaanide tutvustus KUULATI: Liis Hamburg – ülevaade IV perioodi tegevustest ja edasistest plaanidest OTSUSTATI: 3.1 Võtta informatsioon teadmiseks 4. Ettepanek projektilepingu muudatuseks KUULATI: Kristjan Kolde – ülevaade projektilepingu muudatuse plaanidest OTSUSTATI: 4. 1 Heaks kiita ettepanek pikendada projekti tähtaega kuni 30.04.2024 ja täiendada Tartu Ülikooli projektitegevuste skoopi. 5 . Küsimused ja arutelu, muud teemad OTSUSTATI: 5.1 Järgmine juhtrühma koosolek toimub 2 7 .0 9 .2022 kell 14.00. (allkirjastatud digitaalselt) (allkirjastatud digitaalselt) Kristjan Kolde Aivi Saar Koosoleku juhataja Protokollija HEALTH SENSE PROJEKT VEEBRUAR – MAI 2022 E-meditsiini keskus Tervisetehnoloogiate instituut Tallinna Tehnikaülikool 2022 pp.kk.aaaa HEALTH SENSE ANDMEMUDEL – TERVISEINFO METAMUDEL Koosvõime-maastiku ühendamine: o Koostöö korraldamine: Juhised, selgitused, reeglid, vajadused o Järjepidevuse sõnastik - ContSys keel (toiming, faktid, algoritmid) o Tähenduse sõnastik – Snomed, loinc, icd, atc jms keeled o Andmelaotuse sõnastik – FHIR keel (profiilid, loendid) o Andmebaaside sõnastik o Süsteemide sõnastik TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL SÕNASTIKU KASUTATAVUSE UURING o Probleem: informatsiooni liikumine erialade ja valdkondade vahel on katkendlik ning vähetõhus o Teooria: ühtne mõistete ruum, standardimisprotsessid ja – arhitektuurid, contsys mudel, andmemudel o Hüpotees: contsys baasil ehitatud andmesõnastik võimaldab valdkonna ekspertidel kujundada ühtne mõistete ruum o Meetod: kasutatavuse analüüs (arusaadavus, tõhusus, järjepidevus) – lugude kogumine, valdkonna analüüs, andmesõnastiku loomine, järjepidevuse analüüs, katkestuste lahendamine o Tulemid: demograafia (osalejad, lood, sõnastik, muutused, ajakulu), kasutatavus (arusaadavus, tõhusus, järjepidevus) o Arutelu: sõnastiku andmemudel (metamudel, protsess, vahendid) võimaldab suunata valdkonna spetsialistid tõhusale tööle TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL EDENEMINE SEISUGA 24.05.2022 Andmesõnastiku Sedelite Muudatused sedelid + analüüsimine ja täiendused tööprotsess Sõnastiku Tagasiside Andmesõnastiku kasutatavuse analüüsimine, esimene test + uuringu muudatuste tagasiside läbiviimine sisseviimine Sisukaardid Sisukaartide Täienduste (map of content) loomine sisseviimine TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL EDENEMINE SEISUGA 24.05.2022 https://publish.obsidian.md/healthsense/ TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL KOOSTÖÖ o Kohtumised perioodil veebruar – mai 2022 o TalTech - Roche – dr. Vallo Volke – diabeedi ja vähi andmekoosseis o HealthSense ja NORDeHEALTH projekt o HealthSense tutvustus “Health For All 2022” üritusel o TalTech – TEHIK – HealthSense tegevused o TalTech – PERH onkoloogia teemaline koostööseminar o EHK ja TalTech koostöö kohtumine TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL EDASISED SAMMUD o Diabeedi, vähi, insuldi projektid -> koostöö andmekogude arendamises – suvi 2022 o Dr. Vallo Volke o Shining Tower Projekt o Dr. Vahur Valvere (PERH) o Haigekassa insuldi projekt (insuldi andmekogu) TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL EDASISED SAMMUD o Sõnastiku pilootprojekt o Vähi ja diabeedi sedelite koostamine – august – oktoober 2022 o Kasutatavuse uuring valdkonna spetsialistide seas – september 2022 – suvi 2023 o Sõnastiku täiendamine, muudatuste sisse viimine - september 2022 – suvi 2023 o TIS-andmete analüüs – viimane andmeväljastus peaks tulema juuni 2022, andmeanalüüs suvi/sügis 2022 o FHIR profiilidega edasi töötamine (koostöö TEHIK’ga) TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL INFO, MÕTTED, ETTEPANEKUD: Projektijuht Liis Hamburg [email protected] TALLINNA TEHNIKAÜLIKOOL Ehitajate tee 5, 19086 Tallinn, Tel 620 2002 (E-R 8.30–17.00) taltech.ee  TEHIK HealthSense Kristjan Kolde Tervise ja Heaolu Infosüsteemide Keskus / Andmeladude talituse juhataja 24.05.2022 Health Sense teekaart 05.2022 Täna 2021 2022 2023 2024 Andmelao füüsiline keskkond - TEHIK Raviteekondade kasulikud andmemudelid - TalTech Andmete obfuskeerija - UT Pseudonüümija mootor - hange Pseudonüümija admin/registriliides Formaliseerija Serialiseerija / Deserialiseerija Andmete analüüsi/esitlemise keskkond - TEHIK Andmevood ja analüüsid SMEdele HealthSense projektidest ‣ ETL: Andmeteenuste X-tee liides (VERX) ‣ Pseudonüümija ‣ (De)serialiseerija ‣ Pikkade tekstide formaliseerija ‣ Õigusruumi teemad – sh. andmekaitse mõjuhinnangud ETL: Andmeteenuste X-tee liides (VERX) Andmevahetuse võimaldamiseks üle X-tee rakendades andmejälgijat ‣ Maht 27 758 (KM-ta) -> 40 373 eurot (KM-ta) + turvatestimine kuni 20 000 ‣ Toimub turvatestimine, tähtaeg 17.06 ‣ Tehtud: ✓ andmebaaside (Vertica, SAP IQ, Oracle) REST OData X-tee serverteenus ✓ REST OData andmelaadimisteenus (klient) Vertica ja Oracle toega ✓ tugi RIA andmejälgija ja TIS auditlog teenustele ‣ Rakenduskohad: Haigekassa, VSR, NAKIS jt. ‣ Plaanis demo riigi IT majade andmehalduse töörühmas Pseudonüümija Andmete kokkusidumiseks andmeid isikustamata ‣ SF raames arendustööd valmis ‣ Toimub turvatestimine ‣ Tehtud: ✓ X-tee backend REST API rakendus ✓ Java SDK klientrakenduse teek ✓ CLI näidisrakendus ‣ Edasine plaan: ‣ Demo riigi IT majade andmehalduse töörühmas ‣ Vajaduste kaardistamine registrite pseudonüümija alal (HealthSense edasiarendused) Õigusruumi teemad I TEHIKu andmeväljastuse kaardistus: täna vs Health Sense • Tänane olukord (tehnilised ja juriidilised probleemid) TEHIKus on kaardistatud; • Eetikakomiteed Eestis on kaardistatud; • Andmete taotleja protsess (sh EBIN eetikakomitee vaade) on kaardistatud. II Terviseandmete teisene andmekasutus • Tegevuse juhtimine läbi UpTIS projekti, täpsemad tegevused selguvad sügisel. III Muud Health Sense õigusteemad • Audit - Health Sense projekti vastavus GDPR nõuetele. IV Edasised plaanid • Healt Sense to-be vaate kokkupanek ja kirjeldamine (andmeväljastuse vaatest); • Koos vastutava töötlejaga (SoM) hindamine, kas andmeteenustele, mis hakkavad kasutama Vertica X-tee liidest, on vaja teha andmekaitse mõjuhinnangud. Kui jah, siis abistada nende koostamisel. (De)serialiseerija Tervisedokumentidest andmete kätte saamine ‣ Tehniliselt keeruline ja paljuski käsitööd nõudev protsess ‣ Tehakse mitmel rindel korraga (andmeladu, andmevaatur, upTIS, HealthSense) – saame osaliselt ühildada ‣ Arvestame FHIR tulevikuga ja CDA->FHIR mappingutega ‣ Tartu Ülikoolil terviseandmete alane kompetents olemas  HealthSense Tartu Ülikooli projekti plaan SKAIS1 (De)serialiseerija orienteeruv ajakava ja tulemid ‣ Sept 2022 - Arenduskeskkond Tartu jaoks püsti, pseudonüümitud andmed Vertica testkeskkonnas, TÜ saab nendele ligi; ‣ Jaan 2023 - Andmete transformatsioon JSONisse (JSON fikseeritud) + NAKISe jaoks vajalikud tabelid olemas (aga mustade andmetega). Ilma epikriisideta; ‣ Mai 2023 - Täiendatud NAKIS, vajadusel koos epikriisidega; ‣ Sept 2023 - Täiendatud JSON baas (asjad lisaks NAKISele); ‣ Jaan 2023 - Rakenduste ehitamine, töövahendid tabeldamiseks; ‣ Apr 2024 - teisenduste testimine ja versioneerimine. Mis ootab ees? ‣ ETL ‣ Andmeteenuste CI/CD arendusprotsessis ‣ Andmelaadimiste ajastamine (AirFlow) ‣ Teenuste käideldavuse parandamine - monitooring ‣ Avaandmed ‣ Tableau analüütikalahenduste tõlkelahendus ‣ Tableau analüütikakeskkonna TARA liidestus ‣ Masinloetavate avaandmete/opendata teenuse arendus ‣ Pseudonüümija registrite lahendus (sh Tableau) ‣ Andmekvaliteedi tagamise algoritmid, integratsioonid Muudatused HealthSense projektis ‣ Tähtaja pikendamine kuni 04. 2024 ‣ Tartu Ülikooliga obfuskeerija projekti täiendamine tervisedokumentidest andmete väljavõtmise lahenduse proof-of-concept lahenduse väljatöötamiseks ‣ Võimalikud täiendused 2022 IV kvartal Tänan, et võtsid aega kaasa mõtlemiseks! Kristjan Kolde [email protected]  Andmete hägustamine veebruar 2022 – mai 2022 ülevaade 24.05.2022 Juhtrühma koosolek Sulev Reisberg, Ph.D. [email protected]  Eesmärk: Luua andmete hägustamise tööriist Patsient Dgn Elukoht Patsient Dgn Elukoht 1 E11.9 Haava 1 E11 Haava tn 33-2 Hägustaja 2 O80.0 Kajaka 2 O80 NA talu … … 1. Andmeaudit Tegevused 2. Privaatsusmeetmete analüüs 3. Nn utility (kasulikkuse) meetmete analüüs 4. Hägustusmeetmete arendus 5. Privaatsuse ja kasutatavuse vahel optimaalse balansi leidmine 6. Tarkvara arendus 7. Testimine Käesoleva perioodi ülevaade Veidi muutunud eesmärk: ● Viia hägustamistarkvara sellisesse staadiumisse, et ta ta oleks praktiliselt “valmis” ○ See võimaldaks allesjäänud eelarve/ajakava raames keskenduda muudele Health Sense tegevustele Üleantavad tööd Perioodi lõpul antakse üle: • tarkvara kood zip-paketina • koodi README tarkvara sisemise loogika ja funktsionaalsuse kirjeldusega, instaleerimis- ja kasutamisjuhisega Tarkvara lühiülevaade 1/2 Peamine funktsionaalsus: • sisendfailist andmete laadimine • üldistamishierarhiate laadimine ja uute automaatne loomine • sisendandmete veergude tüübituvastus, valideerimine • anonüümimine, kasutades ARX komponenti • anonüümimiskvaliteedi hindamine • väljundfaili salvestamine Tarkvara lühiülevaade 1/2 • Kõik töötab Docker konteineris • Sisemiselt: kirjutatud Python v3 programmeerimiskeeles Tarkvara tutvustav video: https://tinyurl.com/msrdmcpv Projekti raames valmis kolm bakalaureusetööd: Privaatsust tagavad anonüümimistarkvarad. Alikas, Allan Lõputöö eesmärk on võrrelda üldistamisel põhinevaid anonüümimistarkvarasid, et võtta neist sobivaim kasutusele Health Sense projektis. Võrdlusse kaasati kolm tarkvara: ARX, Amnesia ja Anonimatron. Võrdlus viidi läbi 10 hindamiskriteeriumi alusel, millest osad pärinevad ISO-9421 standardist ja osad tulenevad Health Sense projekti vajadustest. Võrdluse läbiviimiseks loodi 3 komplekti testandmeid, mida kasutati anonüümimisel sisendina. Sobivaimaks tarkvaraks osutus ARX, mis integreeriti Health Sense projektis valmivasse tarkvarakomplekti. Terviseandmete tabeli veergude automaatne tüübituvastus. Mumm, Kristina Töö eesmärgiks on luua automaatne veergude tüübi tuvastamise komponent projekti Health Sense raames loodavale terviseandmete anonüümimise tarkvarale. Täpsemalt keskendub komponent terviseandmetele, mis sisaldavad sageli kategoorilisi andmeid. Tüübi tuvastamise protsess jagati kolmeks osas. Regulaaravaldiste abil leitakse, milliste andmetüüpide struktuuriga veeru väärtused sobivad. Seejärel kontrollitakse veeru väärtuste vastavust leitud andmetüüpide lubatud väärtuste loendiga. Viimases sammus valitakse sobivatest andmetüüpidest kõige sobilikum. Lisaks analüüsitakse töös Eesti terviseandmeid, et aru saada, kas terviseandmetes esinevad vead võivad olla probleemiks tüübi tuvastamise juures. Andmete üldistamisel põhineva anonüümimise kvaliteedi hindamine. Tavits, Joosep Bakalaureusetöös käsitletakse andmete anonüümimist ja selle kvaliteedi mõõtmist ühe tüüpilise tihedalt andmeväljastustega kokku puutuva organisatsiooni vaatest. Töö raames tuvastatakse kasutatavate anonüümimismeetodite ja lõppkasutaja kirjelduse põhjal sobiv alamhulk anonüümimise kvaliteedi mõõdikud. Seejärel realiseeritakse need mõõdikud olemasoleva anonüümimistarkvara väljundi analüüsimise komponendina, et kirjeldada anonüümimise tulemusel alles jäänud riske ja andmestikus toimunud muudatusi. Aitäh! Saatja: <[email protected]> Saadetud: 27.07.2022 15:12 Adressaat: Tervise ja Heaolu Infosüsteemide Keskus <[email protected]>; <[email protected]>; Connected Health Cluster <[email protected]>; MKM info <[email protected]>; Terviseamet <[email protected]>; Tervise Arengu Instituut <[email protected]> Teema: Tervise infosüsteemi andmevaramu (Health Sense) projekti juhtrühma protokoll Tere! Teile on saadetud Sotsiaalministeeriumi dokumendihaldussüsteemi Delta kaudu dokument. Saadame uuesti e-meiliga, kuna DVK info näitab, et pole kohale läinud.Pealkiri: Tervise infosüsteemi andmevaramu (Health Sense) projekti juhtrühma protokoll Registreerimise kuupäev: 05.07.2022Lugupidamisega Sotsiaalministeerium Suur-Ameerika 1, 10122 TallinnTel. (372) 626 9301, faks (372) 626 9209e- post: [email protected]