Pöördumine

UURINGU EETILISE HINDAMISE TAOTLUS EESTI BIOEETIKA JA INIMUURINGUTE NÕUKOGULE 1. Uuringu nimetus COVID-19 haigusjuhtumite analüüs ja riskirühmade väljaselgitamine Eestis 2. Uuringu põhieesmärk Uuringu eesmärgiks on Eestis SARS-Cov-2 nakatunute haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgede süsteemne analüüs, mis võimaldab teha informeeritud otsuseid tulevaste nakkuspuhangute korral ja arendab tervise/administratiiv andmete kasutamist meditsiiniliseks otsusetoeks, rahvatervise seireks, tervise teenuste planeerimiseks ning meetmete efektiivsuse, põhjendatuse analüüsiks. 3. Vastutava(d) uurija(d) ning tema (nende) kontaktandmed Eesnimi: Anneli Perekonnanimi: Uusküla Ametikoht: professor Organisatsioon: Tartu Ülikool Telefon: 7374195 e-post: [email protected] Skype: anneli.uuskula 4. Uuringu läbiviijad 1. Eesnimi: Raivo Perekonnanimi: Kolde Ametikoht: terviseinformaatika vanemteadur Organisatsioon: Tartu Ülikool 2. Eesnimi: Heti Perekonnanimi: Pisarev Ametikoht: biostatistika assistent Organisatsioon: Tartu Ülikool 1  3. Eesnimi: Tatjana Perekonnanimi: Meister Ametikoht: ravijuhendite metoodikanõunik / doktorant Organisatsioon: Tartu Ülikool 4. Eesnimi: Anna Perekonnanimi: Tisler Ametikoht: rahvatervishoiu nooremteadur / doktorant Organisatsioon: Tartu Ülikool 5. Eesnimi: Krista Perekonnanimi: Fischer Ametikoht: matemaatilise statistika professor Organisatsioon: Tartu Ülikool 5. Uuringu finantseerimine Finantseerimise allikad RITA1 programm, projekt RITA1/02-120 Uuringu üldmaksumus (summa) 530 000 eurot Uuritavale kompensatsiooni na maksmine (jah, ei, põhjendus ja summa) Uuritavate kindlustus (jah, ei, na kindlustaja ja poliis) 6. Uuringu läbiviimise aeg (algus ja lõpp kuu ja aasta täpsusega) Detsember 2021 – märts 2027 7. Teave sama uuringu projekti varasema või samaaegse hindamise kohta (sh teistes riikides) Uuringu projekt on kooskõlastatud TÜ inimuuringute eetikakomitee poolt (Protokolli number: 351/M-8, koosolek: 18.10.2021) (Lisa 3) TÜ inimuuringute eetikakomitee on kooskõlastanud uuringu läbiviimise korra (sh Terviseameti, Eesti Haigekassa, Rahvastiku ning surma põhjuste registri andmete kasutuse). EBIN-ile esitame taotluse uuringu tarbeks Terviseinfosüsteemist andmete taotluseks. 2  8. Lühiülevaade siiani samal teemal tehtud uuringutest COVID-19 pandeemia on olnud pretsedenditu rohkem kui ühes aspektis. Pandeemia globaalne levik leidis aset vähem mõne kuu jooksul. Vastuseks pandeemiale rakendati enneolematud ulatusega efektiivsed rahvastiku põhised mitte- farmakoloogilised nakkuse leviku tõkkemeetmed. Kuue kuu jooksul disainiti, katsetati ja suunati praktikasse kasutamiseks Covid-19 vaktsiinid. Kui 2020.aastal oli oluliseks väljakutseks SARS-CoV-2 nakkuse ja Covid-19 haiguse raske kuluga seotud riskitegurite (prognoosi) selgitamine, siis 2021.aastaks, kui arenenud riikides on kiiresti tõusnud rahvastiku kaetus Covid-19 vaktsinatsiooniga on oluliseks selgitada vaktsineeritute hulgas korduva Covid-19 põdemisega seotud riskitegurid ning haiguse kulu iseärasused vaktsineeritute hulgas. Jätkunud on Covid- 19 pandeemia, nakatunutega nii varem haigust põdenud kui ka vaktsineeritute hulgas. Oluline on hinnata erinevates rahvastikurühmades nakatumise riski ning korduva/kõrgema nakkuseriskida tegureid (tervislikud, sotsiaal-majanduslikud). Lisaks, vaktsineerimis-programmi puuduste ja tugevuste hindamiseks on kriitilise tähtsusega hinnata kirjeldada vaktsiinide tõhusust tavatingimuses (ingl real-world vaccine effectiveness) kasutamisel. Vaktsiinide kliinilistesse uuringutesse värvatakse tavaliselt noori ja terveid inimesi, samal ajal kui reaalses elus kasutatakse vaktsiini ka vanematel ja krooniliste haigustega inimestel. Tavakasutuse VE-uuringutes saab hinnata vaktsiini efektiivsust erinevates vanuse- ja riskirühmades, kaitsva toime kestvust, suhtelist efektiivsust võrreldes teiste vaktsiinidega, seost manustatud dooside arvu ja ajaga ning efektiivsust uute SARS-CoV-2 tüvede suhtes. Taotluse esitamise ajal on Eestis kasutusel neli erinevat vaktsiini (mRNA vaktsiinid: Pfizer- BioNTech Comirnaty, Spikevax (COVID-19 Vaccine Moderna); ja viirusvektoriga vaktsiinid: Vaxzevria (COVID-19 Vaccine AstraZeneca), COVID-19 Vaccine Janssen). 9. Planeeritava uuringu põhjendus ning uurimisküsimused ja/või hüpoteesid Praeguseks on teaduskirjanduses avaldatud uuringud Covid-19 nakatumise ja raske haiguse kulu riski anlaüüsidest, kirjeldatud erinevate vaktsiinide efektiivsust ning korduvate nakatumiste riski valitud rahvastikurühmades (tervishoiutöötajad, hooldekodude elanikud, leibkondade uuringud) (Booth 2021; Shi 2021; Harder 2021; Higdon 2021). Jätkuvalt on vajalik teave haigestumise/korduvahaigestumise kulu (sh haiguse raskuse), riski ning seotud tegurite kohta kogu rahvastikupõhistest uuringutest (sh laste hulgas ja eakatel). Käesoleva taotluse eesmärgid on sõnastatud ülal. Tegemist on juba töös oleva projektiga, milles kasutame üle/riiklike andmebaaside isiku-põhiselt lingitud andmeid. Kogutud andmeid kasutatakse COVID-19 juhtude haigestumise/korduva haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgede analüüsiks ning haigestumise/korduva 3  haigestumise, haiguse kulu ja kaugtagajärgedega seotud tegurite välja selgitamiseks ning riski(prognoosivate) mudelite välja töötamiseks. Lisaks hindamine COVID-19 haigestumise/korduva haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgi esialgu uuringusse kaasatud nakkusevabadel isikutel (326460 kontroll isikut, kellel perioodil 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021 positiivsetSARS-CoV-2 RNA testi ei olnud). Nakatumisega seotud (riski)tegurid selguvad COVID-19 juhtude võrdlemisel kontrollidega (Joonis 1). COVID-19 haiguse raskete kuluvormidega (vajas hospitaliseerimist; vajas intensiivravi) ja surmaga seotud tegurite määratlemiseks kasutame COVID-19 juhtude rühma sisene võrdlust. (Joonisel 2 on esitatud uuringu põhimõtteline ülesehitus). Põdenute hulgas korduva nakatumise, Long-Covid-19 hindamiseks ning põdemise/vaktsineerimise, tervise ja sotsiaaldemograafiliste tegurite mõju analüüs toimub uuringusse kaasatute „jälgimisel“ kasutades riiklike (tervise)andmebaase (Terviseamet, Haigekassa, Surma põhjuste register, Rahvastiku register) alusel. Joonis 1. Uuritavate määratlemine, uuringu küsimused ning andmete allikad. EBIN-ile esitame taotluse Terviseinfo süsteemidest uuritavate kohta täiendavate andmete saamiseks (SARS-Cov-2 testimise andmed, sh negatiivselt testimise episoodid ning detailse Covid-19 vaktsineerimise andmed). Joonisel 2 on esitatud uuringu eesmärkide kaupa kasutatud andmete allikad (Joonis 2) 4  Joonis 2. Andmete abstraktsiooni eesmärk, allikad ja perioodid. 10. Uurimismetoodika Kõnealune uuring on riiklike (tervise)andmebaaside põhine. Uuringusse on kaasatud ajavahemikus 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021 COVID-19 diagnoosi saanud isikute (86615 juhtu) ning ilma COVID-19 diagnoosita Eestis elavad kontrollisikute (326460 kontrolli) andmed. Andmekogumine Uuringu valim moodustub COVID-19 haigusjuhtudest ning Eestis elavatest kontrollidest. COVID-19 juhud on identifitseeritud Terviseameti (nakkushaiguste infosüsteem NAKIS) ja Haigekassast ning kontrollid Haigekassas andmebaaside alusel. Juhud - ajavahemikus 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021 SARS-CoV-2 positiivse RNA testi ja / või Covid-19 haiguse kliinilise diagnoosi saanud isikud; Kontrollid - ajavahemikus 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021 COVID-19 diagnoosita Eestis isikud, indentifitseeritud Haigekassast kindlustatute nimistust juhuvalimi alusel - iga juhu kohta neli kontrolli kasutades tihedusvalikut (ingl density sampling). Andmete koosseis ja põhjendus Juba olemasolevad andmed: (a) Terviseameti nakkushaiguste infosüsteem NAKIS-s: COVID-19 juhtude ja kontrollide kohta järgmised andmed, taotletav andmekoosseis: vaatlusaluse isikukood; SARS-CoV-2 analüüsiks proovi võtmise kuupäev/kuu/aasta; testi teostamise kuupäev/kuu/aasta ning oletatav nakatumise koht. 5  (b) Rahvastikuregister: kõikide uuritavate (juhud, kontrollid) kohta kodakondsus, elukoha andmed (maakond, linn/maa), viibimiskoha aadress (maakond, linn/maa), perekonnaseis (vallaline, abielus, lesk, lahutatud); kõrgeim omandatud haridustase; rahvus; emakeel. © Haigekassa andmebaasid: COVID-19 juhtude ja kontrollide kohta järgmised andmed: vaatlusaluste isikukood (võimaldavad linkimist Surmapõhjuste registriga); isiku elukoht (asula täpsusega); kõigi raviteenuste arvete ja retseptide kõik andmed. (d) Eesti Surma põhjuste registrist küsitakse COVID-19 juhtude ja kontrollide kohta järgmised andmed: surma aeg (päev, kuu, aasta), surma põhjus (kõik; sh välispõhjusest tingitud surmaga seotud tegurid), surma registreerinud arst ja tema raviasutuse andmed. Kõigist andmebaasidest taotleme uuritavate andmed jälgimisaja alguses ja korduvalt jälgimisaja lõpuni. EBIN-ile esitame taotluse Terviseinfosüsteemist uuritavate kohta täiendavate andmete saamiseks: (1) SARS-Cov-2 testimise andmed (RNA, seroloogilised testid) Käesoleval ajal on uuringu meeskonnal vaid uuritavate SARS-CoV-2 RNA positiivsete testide tulemused (kuni 20.11.2021). Korduvate SARS-CoV-2 nakkuste ja pikaajalise SARS- CoV-2 RNA eritumise eristamiseks on vajalikud ka SARS-CoV-2 RNA negatiivsete testide tulemused ja seroloogiliste testide tulemused (Mukherjee 2021; Sotoodeh Ghorbani 2021) (2) detailsed Covid-19 vaktsineerimise andmed. Käesoleval ajal on uuringu meeskonnal uuringu meeskonnal uuritavate Covid-19 vaktsineerimiste teostamise kuupäevad (Haigekassa andmed). On võimalik, et sellest andmestikust puuduvad mõnede sihtrühmade (nt osad tervishoiutöötajad) vaktsinatsiooni andmed ja meil ei ole kasutatud vaksiinide detailseid andmeid (milline vaktsiin). Plaanitud uuringu eesmärkide täitmisel on oluline ja eelistatud võimalikult täpsed ning detailsed algandmed. Terviseinfosüsteemi andmeid soovime perioodist algusega 26.02.2020 kuni märts 2027. 11. Uuritavate valim ja värbamise viisi kirjeldus. Uuritavaid ei värvata Valimi kirjeldus: Analüüsime perioodil 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021.a. COVID-19 diagnoosi saanud isikute (SARS-CoV-2 positiivne RNA test n= 66 295, Covid-19 kliiniline diagnoos n= 24 053) ning ilma COVID-19 diagnoosita Eestis kontrollisikute (n= 348 885) andmeid. 12. Koeproovide väljastamine kolmandatele osapooltele (RNA, DNA, plasma vms) Koeproove ei koguta 13. Uuringu eetiliste aspektide analüüs 6  15. Isikuandmete kaitse meetmete kirjeldus, sealhulgas andmete hoidmise, säilitamise, turvalisuse ja kustutamise kohta, sh andmete ja/või koodivõtme kustutamise kuupäev Uuring viiakse läbi andmepõhiselt ilma uuritavate isikutega füüsiliselt kokku puutumata. Uuritavate isikute ega nende lähedastega ühendust ei võeta ja seega ei kaasne andmesubjektidele uuringus osalemisega ebamugavusi ega ohte. Seevastu annab iga uuringukriteeriumitele vastava subjekti kaasamine mõõtmatut väärtust uuringu tulemustele, kuna vaid võimalikult täielikud andmed annavad tõepärase ülevaate olukorrast. Uuringus kasutatakse isikustatud andmeid, mille puhul on risk konfidentsiaalsuse rikkumiseks ja andmete lekkimiseks. Andmete kogumisel, säilitamisel ja analüüsil järgitakse Isikuandmete kaitse seadust. Isikuandmete kogumise põhjendus Uuringus kasutatakse eri allikatest pärinevaid andmeid, kus ühe andmesubjekti kohta käiv info kogutakse kokku eri andmebaasidest. Ilma isikuandmeid kasutamata ei ole uuringu läbiviimine võimalik. Käesolevas uuringus ei ole andmesubjekti teavitamine põhjendatud kuna:  andmete töötlemine ei kahjusta andmesubjekti huve, sest väljund on teaduslik üldistus;  loa küsimine oleks seotud ebamõistlikult suurte kuludega;  nõusoleku mittesaamine osa isikute poolt vähendaks üldistuste valiidsust. Avaliku huvi olemasolu Uuringul on suur teaduslik väärtus, kuna tekkiv rahvastiku põhine/üle-eestiline valim vaba uuringusse valikulise kaasamisega (nt ainult haiglaravi saanute põhine valim) seotud kallutatusest. Ühtlasi võimaldab uuring analüüsida tegureid, mis võivad mõjutada haigestumise, haiglaravi vajaduse ja surma riski. Sellise tõenduse loomine Eesti jaoks on võimalik ainult kasutades kohalikke andmeid ja on aluseks haigestumise riski stratifitseerimiseks. Enam ohustatud rahvastikurühmade välja selgitamine on oluline ennetavate meetmete (informeerimine, shielding) prioriseerimiseks. Uurija leiavad, et projekti teaduslikel eesmärkidel on ülekaalukas avalik huvi ja see teenib ühiskonna huve. Uuringu käigus hindame esinduslikel rahvusvahelistel kohortidel välja töötatud riski hindamise mudeleid nii täpsuse kui ka rakendatavuse osas, eesmärgiga luua riiklikel tervise/administratiivandmetel põhinev varane tõsist haigusekulgu prognoosiv riskikalkulaator. Tulemusi saab kasutada ka COVID-19 haiguskoormuse ja ennetavate meetmed efektiivsuse hindamise modelleerimisel eelduste informeerimiseks. Kasutades Eesti andmeid tagame, et väljatöötatav riskimudel on õpitud võimalikult laiapõhjalisel andmestikul, kuid võtab arvesse ka Eesti eripärasid. Isikuandmete töötlemine Isikuandmed on vajalikud andmete kogumise etapis, eri andmebaaside linkimiseks. Päringuid andmete taotluseks tehakse vastavalt kehtivatele nõuetele. Haigekassale, surma põhjuste ja rahvastiku registritele ning terviseinfosüsteemi edastatakse uuritavate isikukoodid koos uuringukoodiga ning Haigekassa tagastab päringu tulemused ainult uuringukoodiga. Andmete transportimisel rakendatakse rangeid turvanõudeid, elektroonne andmevahetus Terviseameti (NAKIS), Terviseinfosüsteemi, surmapõhjuste ja rahvastiku 7  registrite ja Haigekassaga toimub krüpteeritult (TÜ poolt on krüpteeritud andmevahetusega tegelejaks peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituudi analüütik Heti Pisarev). Kui linkimised on tehtud, genereeritakse kõigile uuringusse kaasatud isikutele unikaalne uuringukood (pseudonüüm), eraldatakse isikut tuvastada võimaldavad isikuandmed terviseandmetest ja edaspidi kasutatakse analüüsil pseudonüümitud andmeid. Andmeid töötlevad uuringu täitjad. TÜ-s psedonüümib andmed peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituudi analüütik Heti Pisarev. Andmeid hoitakse ja töödeldakse Tartu Ülikooli (TÜ) turvatud serveris. Fail, milles on isikut tuvastatavad tunnused ja uuringunumber, säilitatakse eraldi pseudonüümitud andmetega tööfailist ja krüpteeritud kujul TÜ serveris kuni märts 2027. Isikustatud andmetele on ligipääs ainult analüütik Heti Pisarevil ja vastutaval uurijal Anneli Uusküla. Isikustatud andmeid töödeldakse turvatud serveris. Isikuandmete töötlemispaigas TÜ-s on isikuandmete kaitseks võetud kasutusele piisavad organisatsioonilised, füüsilised ja infotehnoloogilised turvameetmed. Peale uuringu lõppu (märts 2027) andmed anonümiseeritakse ning säilitatakse teadustöö eesmärgil tähtajatult. Uuringuandmete vastutav töötleja on TÜ. Isikuandmete töötlemisel arvestame minimaalsuse põhimõtet.1 Kogume isikuandmeid vaid ulatuses, mis on vajalik määratletud eesmärkide saavutamiseks. Uuringurahastaja on lähteülesandes nimetanud, et COVID-19 haigestumisega seotu on uudne valdkond ning uuringu tulemus inimeste tervise ja tervisekäitumusliku ning COVID-19-sse haigestumise vahel on väga suurel määral ennustamatu.2 Uuringu eesmärkide täitmiseks vajame võimalikult täielikku uuritavate haigestumist ja tervisekäitumist kajastavat informatsiooni Eesti tervise/administratiivsetest andmebaasidest (Surma põhjuste register, Eesti Haigekassa, Terviseamet). Uuringu kavandamise ajal ei ole informatsiooni, mis põhjendaks andmeväljavõtu piirangud mõne haiguse vms lõikes. Vastutav uurija tagab, et andmete töötlemisel järgitakse kõiki seadusest tulenevaid ja väljastamise korralduses nimetatud andmekaitse põhimõtteid. Kogutud andmeid kasutatakse ainult uurimistöö eesmärkidel ja ulatuses. Uuringus kogutud andmeid ei ekspordita. Tulemused avaldatakse rühmitatud näitajatena, uuritavaid isikuid eraldi välja ei tooda. Uuringu tulemused avaldatakse teaduspublikatsioonidena. Andmete publitseerimine üldistatud kujul ei võimalda uuritavate identifitseerimist. Uuringu läbiviimise eelduseks on eetikakomitee nõusolek. 14. Täita, kui uuring põhineb andmekogu ja/või andmeallika andmetel. Andmekogu ja/või andmeallika nimetus Terviseinfosüsteem Isikuandmete töötlemise eesmärk 1 Isikuandmete kaitse seadus. § 6. Isikuandmete töötlemise põhimõtted. RT I 2007, 24, 127 (https://www.riigiteataja.ee/akt/130122010011?leiaKehtiv) 2 ETAG. Algab konkurss koroonaviiruse kulgu ja tõsidust mõjutavaid tegureid analüüsiva uuringu läbiviija leidmiseks (05.05.2020). Lähteülesanne. https://www.etag.ee/algab-konkurss-koroonaviiruse-kulgu-ja-tosidust-mojutavaid- tegureid-analuusiva-uuringu-labiviija-leidmiseks/ 8  Teadusuuringu eesmärkide täitmine Andmekoosseis ja periood, mille kohta andmed kogutakse (vajadusel lisana) (1) SARS-CoV-2 test: proovi võtmise kuupäev, materjal, analüüs (SARS koroonaviirus 2 RNA, SARS koroonaviirus 2 RNA antikehad); tulemus (sh ühik, referentsväärtus); testi tegemise kuupäev; testi kogumise koht. (2) SARS-CoV-2 immuniseerimise andmed: immuniseerimise aeg, immuunpreparaadi nimetus, kava/programm; ATC kood ja nimetus; partii, manustatud annus, annuse kordsus, vaktsinatsiooni staatus. Terviseinfosüsteemi andmeid soovime perioodist algusega 26.02.2020 kuni märts 2027 (väljavõtud sagedusega üks kord aastas). Kinnitan, et kõik uuringu läbiviijad on teadlikud projekti läbiviimisega kaasnevatest eetilistest ja isikuandmete kaitsega kaasnevatest nõuetest. Vastutava uurija allkiri Taotluse esitamise kuupäev Anneli Uusküla 23.11.2021 /digiallkiri/ Paranduse esitamise kuupäev 21.12.2021 Taotluse EBIN ID (täidab hindaja) Lisadokumentide loetelu: Lisa 1. Vastutava uurija CV Lisa 2. Kasutatud kirjanduse nimistu Lisa 3. TÜ inimuuringute eetikakomitee kooskõlastus projektile. 9 Lisa 1. CURRICULUM VITAE ÜLDANDMED Nimi ANNELI UUSKÜLA Haridus State University of New York, School of Public Health, USA teadusmagistrikraad (MSc Epidemiology), 2003 Tartu Ülikool, meditsiinidoktor, 2001 Tartu Ülikool, eriala residentuur (dermatoveneroloogia), 1997 Tartu Ülikool, üldinternatuur, 1993 Tartu Ülikool, arstiteaduskond, 1991 Teenistuskäik 2007. a. alates, TÜ tervishoiu instituut, epidemioloogia professor 2007-2020, TÜ rahvatervishoiu magistriõppe programmijuht 2007–2009, TÜ tervishoiu instituut, juhataja 2004–2007, TÜ tervishoiu instituut, vanemteadur 2002–2003, TÜ tervishoiu instituut, erakorraline teadur 1995–1997, TÜ nahahaiguste kliinik, vanemassistent 1994–1995, TÜ nahahaiguste kliinik, vanemlaborant 2000. a. alates, TÜ Kliinikum, nahahaiguse kliinik, arst-õppejõud TEADUSTÖÖ JA ARENDUSTEGEVUS Peamised uurimisvaldkonnad (i) Peamised teadusööd hõlmavad krooniliste haiguste (sh. uimastitarbimisega) ja nakkushaigustega (HIV, HCV, HPV, sugulisel teel levivad haigused, SARS-CoV-2) seotud suremuse ja haigestumuse uurimist (Covid-19 epideemia kulg ja mõju, süstlavahetusprogrammide, ennetus/ravi teenuste mõjude ning riskeeriva tervisekäitumise mõju tervise kahjude kujunemisele ja/või ennetamisele) (ii) Teostatud teadustöö ühendab prekliinilise, kliinilise ja rahvatervishoiu tasemel rakendatud sekkumisprogrammide tõhususe hindamise kasutades teaduslike (epidemioloogilisi) uurimismetoodikaid. Tervist taastavate või haigusi ennetevate sekkumiste (tõhususe) uuringud on läbiviidud kasutades kvasi-eksperimentaalseid ja eksperimentaalseid (juhuslikustatud kontrollitud katse, ingl randomised controled trial) metoodikaid (iii) Rahvusvahelise teaduskirjanduse süstemaatilised ülevaated (sh ka metanalüüs) (iv) Teadustöö üheks väljundiks on inimuuringute metoodiline arendustöö; sh teadusuuringuteks kasutatud metoodikate analüüs. 10 Joonis 1. Publitseeritud teadustööde teemade valdkonnad. Teaduspublikatsioonid Tabel 1. Avaldatud teadustööd Eelretsenseeritavad Ajakiri Eesti Arst Muu rahvusvahelised teadusajakirjad Üldarv 132 14 14 Viimased viis aastat 39 3 8 H-indeks: 22 (Web of Science, 08.09.2021) Kõigi rahvusvahelistes eelretsenseerivates ajakirjades publitseeritud artiklite loend Lisas. Teadustöö juhendamine Viimasel 10 aastal on A. Uusküla juhendamisel kaitstud 20 magistritööd ja 5 doktoritööd. Juhendamisel on 5 doktoritööd. 11 Saadud uurimistoetused ja lepingud Tabel 2. Kokkvõte saadud uurimistoetustest ja lepingutest (viimased 10 aastat) Uuring Periood Teemajuht Rahastaja Rahvusvaheline rahastus Developing an infrastructure and 2020- Uusküla A ECDC (Haiguste performing vaccine effectiveness 2022 ennetamise ja tõrje studies for COVID-19 vaccine in the Euroopa keskus) EU/EEA Towards elimination of cervical 2019- Uusküla A EEA and Norway cancer: intelligent and personalised 2023 Grants solutions for cancer screening Combined prevention to reduce 2015- Des Jarlais, Don NIH (USA) initiation into injecting drug use 2020 (USA, Mount Sinai Beth Israel) / Uusküla, Anneli Transfer of UK training programme 2013- Cliodna McNulty (UK, LLP Leonardo to improve chlamydia testing in GP 2015 Health protection transfer of innovation practices in Estonia, France and Agency) Sweden Influences on HIV Prevalence and 2010- Uusküla, Anneli/ NIH (USA) Service Access among IDUs in 2015 Herimer, Robert Russia and Estonia (USA, Yale University) Multiple Prevention Packages for 2009- Des Jarlais, Don NIH (USA) IDUs in Estonia 2014 (USA, Mount Sinai Beth Israel) Klamüdioosikontroll Euroopas 2012– Low, Nicola ECDC (Haiguste 2014 (Switzerland, ennetamise ja tõrje University of Bern) Euroopa keskus) Capacity building for disease 2007- Uusküla, Anneli EEA and Norway surveillance and health monitoring 2011 Grants in Estonia. Kohalik rahastus COVID-19 haigusjuhtumite analüüs 2020- Uusküla, Anneli RITA1/02-120-01 ja riskirühmade väljaselgitamine 2022 Eestis 12 Aastatel 2006–2015 enesetapu 2017- Rooväli, Liis Sotsiaalministeerium sooritanute epidemioloogiline 2018 ülevaade Epidemioloogilised ja rahvatervise 2015- Uusküla, Anneli IUT34-17, Haridus- uuringud tõenduspõhiseks 2020 ja otsustamiseks ja siirdemeditsiini Teadusministeerium toetamiseks Bridging the gap in knowledge and 2012– Uusküla, Anneli Archimedes, practice of prevention and care for 2016 struktruuritoetus HIV in Estonia fondid Osteoporootilise luumurruga seotud 2012– Uusküla, Anneli ETF2012, SA Eesti kulude ja elukvaliteedi uuring 2015 Teadusfond Terviseuuringud tõenduspõhiseks 2009– Uusküla, Anneli SF2009, Haridus- ja otsustamiseks, rakendades 2014 Teadusministeerium klassikalisi ja innovatiivseid epidemioloogilisi meetodeid Muu teaduslik organisatsiooniline ja erialane tegevus Nõukogud, erialaseltsid, eksperdikomisjonid, toimetuskolleegiumid 2012. a alates Eesti Haigekassa ravijuhendite nõukoja liige 2012-2018 Eesti naha- ja suguhaiguste arstide seltsi (ENSAS) juhatuse liige 2011. a alates ajakirja Eesti Arst teadustoimetaja 2009–2012 Eesti Teadusfondi (ETF) terviseuuringute eksperdikomisjoni liige 2007. a alates Eesti Haigekassa rahvatervise komisjoni liige 2007. a alates Euroopa sotsiaaluuringu Eesti nõukogu esimees 2007-2011Vabariigi Valitsuse HIV-komisjoni liige 2007–2012 Sotsiaalministeeriumi dermatoveneroloogia eksperdikomisjoni liige 2006–2012 Eesti naha-ja suguhaiguste arstide seltsi (ENSAS) president 2000. a alates Ravimiameti erialaekspert (dermatoloogia) 1999–2012 Eesti sugulisel teel levivate infektsioonide ühingu (STLIEÜ) juhatuse liige 2011.a. alates ajakiri Eesti arst, teadustoimetaja 2012.a. alates ajakirja BMC infectious diseases, kaastoimetaja Teadusorganisatsiooniline rahvusvaheline tegevus 2016.a alates, European Commision, H2020 Advisory Group for Societal Challenge Health, Demographic Change and Wellbeing, liige 2007. a alates, European Center of Disease Control (ECDC), ekspert 2004. a alates, Euroopa Ravimiamet (European Medicines Agency, EMEA), valideeritud ekspert 1999. a alates, New York Academy of Sciences, liige 13 KLIINILINE RAVITÖÖ Perioodil 2016–2021 töötanud TÜ kliinikumi nahahaiguste kliinikus arsti-õppejõuna 0,25 koormusega (10 tundi ambulatoorset vastuvõttu nädalas), töökoormus ligikaudu 1000 ambulatoorset visiiti aastas (Eesti Haigekassa andmeil). Rahvusvahelistes eelretsenseerivates ajakirjades publitseeritud teadustööd (ainult 1.1 publikatsioonid) A Multistage Process Model of How a Person Who Currently Injects Drugs Comes to Assist 1. Persons Who Do not Inject with Their First Injections. Des Jarlais DC, Arasteh K, Barnes DM, Feelemyer J, Berg H, Raag M, Talu A, Org G, Tross S, Uuskula A. Front Sociol. 2021 Feb 15;6:619560. doi: 10.3389/fsoc.2021.619560. eCollection 2021. PMID: 33869573 Free PMC article. Rapid point-of-care (POC) testing for Hepatitis C antibodies in a very high prevalence setting: 2. persons injecting drugs in Tallinn, Estonia. Uusküla A, Talu A, Rannap J, Barnes DM, Jarlais DD. Harm Reduct J. 2021 Apr 1;18(1):39. doi: 10.1186/s12954-021-00485-5. PMID: 33794927 Free PMC article. Cervical cancer screening patterns among HIV-positive women in Estonia: a population-based 3. retrospective cohort study. Tisler A, Ojavee SE, Veerus P, Soodla P, Uusküla A. BMC Cancer. 2021 Apr 1;21(1):350. doi: 10.1186/s12885-021-08076-0. PMID: 33794821 Free PMC article. Presenting a conceptual framework for an HIV prevention and care continuum and assessing 4. the feasibility of empirical measurement in Estonia: A case study. Uusküla A, Vickerman P, Raag M, Walker J, Paraskevis D, Eritsyan K, Sypsa V, Lioznov D, Avi R, Des Jarlais D. PLoS One. 2020 Oct 9;15(10):e0240224. doi: 10.1371/journal.pone.0240224. eCollection 2020. PMID: 33035238 Free PMC article. Seroprevalence of SARS-CoV-2 antibodies among pregnant women in Estonia: A call for 5. epidemiological studies. Veerus P, Salumets A, Naaber P, Krjutškov K, Tilk K, Laanpere M, Uusküla A. Acta Obstet Gynecol Scand. 2020 Dec;99(12):1736-1737. doi: 10.1111/aogs.13995. Epub 2020 Oct 8. PMID: 32970836 Free PMC article. The fentanyl epidemic in Estonia: factors in its evolution and opportunities for a 6. comprehensive public health response, a scoping review. Uusküla A, Talu A, Vorobjov S, Salekešin M, Rannap J, Lemsalu L, Jarlais DD. Int J Drug Policy. 2020 Jul;81:102757. doi: 10.1016/j.drugpo.2020.102757. Epub 2020 May 13. PMID: 32416523 Free PMC article. Review. Trends in opioid prescribing in Estonia (2011-2017). 7. Uusküla A, Raag M, Kurvits K, Laius O, Uusküla M, Oselin K. Pharmacol Res Perspect. 2020 Apr;8(2):e00577. doi: 10.1002/prp2.577. PMID: 32232953 Free PMC article. The fentanyl epidemic in Estonia: opportunities for a comprehensive public health response. 8. Uuskula A, Jarlais DD, Vorobjov S. ancet Psychiatry. 2019 Dec;6(12):985. doi: 10.1016/S2215-0366(19)30436-5. PMID: 31777349 No abstract available. 14  Implementing an Updated "Break the Cycle" Intervention to Reduce Initiating Persons into 9. Injecting Drug Use in an Eastern European and a US "opioid epidemic" Setting. Des Jarlais D, Uuskula A, Talu A, Barnes DM, Raag M, Arasteh K, Org G, Demarest D, Feelemyer J, Berg H, Tross S. AIDS Behav. 2019 Sep;23(9):2304-2314. doi: 10.1007/s10461-019-02467-y. PMID: 30879209 Free PMC article. Prevalence of injecting drug use in Estonia 2010-2015: a capture-recapture study. 10. Raag M, Vorobjov S, Uusküla A. Harm Reduct J. 2019 Mar 14;16(1):19. doi: 10.1186/s12954-019-0289-3. PMID: 30871554 Free PMC article. Hepatitis C virus prevalence and estimated incidence among new injectors during the opioid 11. epidemic in New York City, 2000-2017: Protective effects of non-injecting drug use. Des Jarlais DC, Arasteh K, Feelemyer J, McKnight C, Barnes DM, Perlman DC, Uuskula A, Cooper HLF, Tross S. Drug Alcohol Depend. 2018 Nov 1;192:74-79. doi: 10.1016/j.drugalcdep.2018.07.034. Epub 2018 Sep 12. PMID: 30243142 Free PMC article. Hepatitis C seropositivity among newly incarcerated prisoners in Estonia: data analysis of 12. electronic health records from 2014 to 2015. Kivimets K, Uusküla A, Lazarus JV, Ott K. BMC Infect Dis. 2018 Jul 21;18(1):339. doi: 10.1186/s12879-018-3242-2. PMID: 30031373 Free PMC article. Association of IFNλ4 rs12979860 polymorphism with the acquisition of HCV and HIV infections 13. among people who inject drugs. Jõgeda EL, Avi R, Pauskar M, Kallas E, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Toompere K, Lutsar I, Huik K. J Med Virol. 2018 Nov;90(11):1779-1783. doi: 10.1002/jmv.25258. Epub 2018 Aug 16. PMID: 29992584 Free PMC article. Clinical Trial. Compliance with Pregnancy Prevention Recommendations for Isotretinoin in Estonia in 2012- 14. 2016. Uusküla A, Pisarev H, Kurvits K, Laius O, Laanpere M, Uusküla M. Drugs Real World Outcomes. 2018 Jun;5(2):129-136. doi: 10.1007/s40801-018-0135-z. PMID: 29790022 Free PMC article. Frequency and factors associated with providing injection initiation assistance in Tallinn, 15. Estonia. Uusküla A, Barnes DM, Raag M, Talu A, Tross S, Des Jarlais DC. Drug Alcohol Depend. 2018 Jul 1;188:64-70. doi: 10.1016/j.drugalcdep.2018.03.048. Epub 2018 May 8. PMID: 29754028 Free PMC article. Another frontier for harm reduction: contraceptive needs of females who inject drugs in 16. Estonia, a cross-sectional study. Uusküla A, Raag M, Vorobjov S, Jarlais DD. Harm Reduct J. 2018 Mar 5;15(1):10. doi: 10.1186/s12954-018-0215-0. PMID: 29506538 Free PMC article. Differences in risk behaviours and HIV status between primary amphetamines and opioid 17. injectors in Estonia and Russia. Tavitian-Exley I, Maheu-Giroux M, Platt L, Heimer R, Uusküla A, Levina O, Vickerman P, Boily MC. Int J Drug Policy. 2018 Mar;53:96-105. doi: 10.1016/j.drugpo.2017.11.010. Epub 2018 Jan 5. PMID: 29306786 Quality of life after hip, vertebral, and distal forearm fragility fractures measured using the EQ- 18. 5D-3L, EQ-VAS, and time-trade-off: results from the ICUROS. Svedbom A, Borgström F, Hernlund E, Ström O, Alekna V, Bianchi ML, Clark P, Curiel MD, Dimai HP, Jürisson M, Uusküla A, Lember M, Kallikorm R, Lesnyak O, McCloskey E, Ershova O, Sanders KM, Silverman S, Tamulaitiene M, Thomas T, Tosteson ANA, Jönsson B, Kanis JA. 15  Qual Life Res. 2018 Mar;27(3):707-716. doi: 10.1007/s11136-017-1748-5. Epub 2017 Dec 12. PMID: 29235059 Quality of life for up to 18 months after low-energy hip, vertebral, and distal forearm fractures- 19. results from the ICUROS. Svedbom A, Borgstöm F, Hernlund E, Ström O, Alekna V, Bianchi ML, Clark P, Curiel MD, Dimai HP, Jürisson M, Kallikorm R, Lember M, Lesnyak O, McCloskey E, Sanders KM, Silverman S, Solodovnikov A, Tamulaitiene M, Thomas T, Toroptsova N, Uusküla A, Tosteson ANA, Jönsson B, Kanis JA. Osteoporos Int. 2018 Mar;29(3):557-566. doi: 10.1007/s00198-017-4317-4. Epub 2017 Dec 11. PMID: 29230511 Using data from respondent-driven sampling studies to estimate the number of people who 20. inject drugs: Application to the Kohtla-Järve region of Estonia. Wu J, Crawford FW, Raag M, Heimer R, Uusküla A. PLoS One. 2017 Nov 2;12(11):e0185711. doi: 10.1371/journal.pone.0185711. eCollection 2017. PMID: 29095866 Free PMC article. Treatment of chlamydia and gonorrhoea, compliance with treatment guidelines and factors 21. associatedwith non-compliant prescribing: findings form a cross-sectional study. Tisler-Sala A, Ojavee SE, Uusküla A. Sex Transm Infect. 2018 Jun;94(4):298-303. doi: 10.1136/sextrans-2017-053247. Epub 2017 Oct 24. PMID: 29066628 Qualitative interviews with healthcare staff in four European countries to inform adaptation of 22. an intervention to increase chlamydia testing. McNulty C, Ricketts EJ, Fredlund H, Uusküla A, Town K, Rugman C, Tisler-Sala A, Mani A, Dunais B, Folkard K, Allison R, Touboul P. BMJ Open. 2017 Sep 25;7(9):e017528. doi: 10.1136/bmjopen-2017-017528. PMID: 28951413 Free PMC article. Preventing Injection Drug use Initiation: State of the Evidence and Opportunities for the Future. 23. Werb D, Bluthenthal RN, Kolla G, Strike C, Kral AH, Uusküla A, Des Jarlais D. J Urban Health. 2018 Feb;95(1):91-98. doi: 10.1007/s11524-017-0192-8. PMID: 28948444 Free PMC article. No abstract available. Cost-effectiveness of HPV vaccination in the context of high cervical cancer incidence and low 24. screening coverage. Võrno T, Lutsar K, Uusküla A, Padrik L, Raud T, Reile R, Nahkur O, Kiivet RA. Vaccine. 2017 Nov 1;35(46):6329-6335. doi: 10.1016/j.vaccine.2017.08.083. Epub 2017 Sep 9. PMID: 28899625 The impact of comorbidities on hip fracture mortality: a retrospective population-based cohort 25. study. Jürisson M, Raag M, Kallikorm R, Lember M, Uusküla A. Arch Osteoporos. 2017 Aug 28;12(1):76. doi: 10.1007/s11657-017-0370-z. PMID: 28849347 Erratum to: The impact of hip fracture on mortality in Estonia: a retrospective population- 26. based cohort study. Jürisson M, Raag M, Kallikorm R, Lember M, Uusküla A. BMC Musculoskelet Disord. 2017 Aug 24;18(1):366. doi: 10.1186/s12891-017-1735-6. PMID: 28836967 Free PMC article. No abstract available. Effects of Counselling on Adherence to Antiretroviral Treatment Among People with HIV in 27. Estonia: A Randomized Controlled Trial. Uusküla A, Laisaar KT, Raag M, Lemsalu L, Lõhmus L, Rüütel K, Amico KR; HIV-BRIDGE Study Group. AIDS Behav. 2018 Jan;22(1):224-233. doi: 10.1007/s10461-017-1859-6. PMID: 28717981 Clinical Trial. 16  Polydrug Use and Heterogeneity in HIV Risk Among People Who Inject Drugs in Estonia and 28. Russia: A Latent Class Analysis. Tavitian-Exley I, Boily MC, Heimer R, Uusküla A, Levina O, Maheu-Giroux M. AIDS Behav. 2018 Apr;22(4):1329-1340. doi: 10.1007/s10461-017-1836-0. PMID: 28699018 Free PMC article. Perceived effectiveness of antiretroviral therapy, self-rated health and treatment adherence 29. among HIV-positive people who inject drugs in Estonia. Chan PY, Joseph MA, Des Jarlais DC, Uusküla A. Int J STD AIDS. 2018 Jan;29(1):13-22. doi: 10.1177/0956462417714635. Epub 2017 Jun 15. PMID: 28618981 The impact of hip fracture on mortality in Estonia: a retrospective population-based cohort 30. study. Jürisson M, Raag M, Kallikorm R, Lember M, Uusküla A. BMC Musculoskelet Disord. 2017 Jun 5;18(1):243. doi: 10.1186/s12891-017-1606-1. PMID: 28583096 Free PMC article. Monitoring quality and coverage of harm reduction services for people who use drugs: a 31. consensus study. Wiessing L, Ferri M, Běláčková V, Carrieri P, Friedman SR, Folch C, Dolan K, Galvin B, Vickerman P, Lazarus JV, Mravčík V, Kretzschmar M, Sypsa V, Sarasa-Renedo A, Uusküla A, Paraskevis D, Mendão L, Rossi D, van Gelder N, Mitcheson L, Paoli L, Gomez CD, Milhet M, Dascalu N, Knight J, Hay G, Kalamara E, Simon R; EUBEST working group, Comiskey C, Rossi C, Griffiths P. Harm Reduct J. 2017 Apr 22;14(1):19. doi: 10.1186/s12954-017-0141-6. PMID: 28431584 Free PMC article. Engagement in HIV care and its correlates among people who inject drugs in St Petersburg, 32. Russian Federation and Kohtla-Järve, Estonia. Heimer R, Usacheva N, Barbour R, Niccolai LM, Uusküla A, Levina OS. Addiction. 2017 Aug;112(8):1421-1431. doi: 10.1111/add.13798. Epub 2017 May 4. PMID: 28233356 Free PMC article. HIV prevalence and gender differences among new injection-drug-users in Tallinn, Estonia: A 33. persisting problem in a stable high prevalence epidemic. Uusküla A, Raag M, Marsh K, Talu A, Vorobjov S, Des Jarlais D. PLoS One. 2017 Feb 2;12(2):e0170956. doi: 10.1371/journal.pone.0170956. eCollection 2017. PMID: 28152026 Free PMC article. The Role of Internalized Stigma in the Disclosure of Injecting Drug Use Among People Who 34. Inject Drugs and Self-Report as HIV-Positive in Kohtla-Järve, Estonia. Johannson A, Vorobjov S, Heimer R, Dovidio JF, Uusküla A. AIDS Behav. 2017 Apr;21(4):1034-1043. doi: 10.1007/s10461-016-1647-8. PMID: 27990583 People living with HIV in Estonia: engagement in HIV care in 2013. 35. Laisaar KT, Raag M, Lutsar I, Uusküla A. Euro Surveill. 2016 Oct 27;21(43):30380. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2016.21.43.30380. PMID: 27813471 Free PMC article. Suicidal Behavior Among People Living with HIV (PLHIV) in Medical Care in Estonia and 36. Factors Associated with Receiving Psychological Treatment. Lemsalu L, Rüütel K, Laisaar KT, Lõhmus L, Raidvee A, Uusküla A; HIV-BRIDGE Study Group. AIDS Behav. 2017 Jun;21(6):1709-1716. doi: 10.1007/s10461-016-1561-0. PMID: 27664013 Screening for genital chlamydia infection. 37. Low N, Redmond S, Uusküla A, van Bergen J, Ward H, Andersen B, Götz H. Cochrane Database Syst Rev. 2016 Sep 13;9(9):CD010866. doi: 10.1002/14651858.CD010866.pub2. PMID: 27623210 Free PMC article. Review. Prevalence and genotypes of GBV-C and its associations with HIV infection among persons who 38. inject drugs in Eastern Europe. Jõgeda EL, Huik K, Pauskar M, Kallas E, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Lutsar I, Avi R. 17  J Med Virol. 2017 Apr;89(4):632-638. doi: 10.1002/jmv.24683. Epub 2016 Sep 16. PMID: 27603233 T Cell Distribution in Relation to HIV/HBV/HCV Coinfections and Intravenous Drug Use. 39. Kallas E, Huik K, Türk S, Pauskar M, Jõgeda EL, Šunina M, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Avi R, Lutsar I. Viral Immunol. 2016 Oct;29(8):464-470. doi: 10.1089/vim.2016.0057. Epub 2016 Aug 26. PMID: 27564643 Free PMC article. A CCL5 Haplotype Is Associated with Low Seropositivity Rate of HCV Infection in People Who 40. Inject Drugs. Huik K, Avi R, Pauskar M, Kallas E, Jõgeda EL, Karki T, Rüütel K, Talu A, Abel-Ollo K, Uusküla A, Carrillo A, Ahuja SK, He W, Lutsar I. PLoS One. 2016 Jun 15;11(6):e0156850. doi: 10.1371/journal.pone.0156850. eCollection 2016. PMID: 27304910 Free PMC article. Human T-lymphotropic virus types 1 and 2 are rare among intravenous drug users in Eastern 41. Europe. Jõgeda EL, Avi R, Pauskar M, Kallas E, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Lutsar I, Huik K. Infect Genet Evol. 2016 Sep;43:83-5. doi: 10.1016/j.meegid.2016.05.022. Epub 2016 May 17. PMID: 27223634 Free PMC article. Quality of life, resource use, and costs related to hip fracture in Estonia. 42. Jürisson M, Pisarev H, Kanis J, Borgström F, Svedbom A, Kallikorm R, Lember M, Uusküla A. Osteoporos Int. 2016 Aug;27(8):2555-66. doi: 10.1007/s00198-016-3544-4. Epub 2016 Feb 23. PMID: 26905271 Differences in T cell distribution and CCR5 expression in HIV-positive and HIV-exposed 43. seronegative persons who inject drugs. Kallas E, Huik K, Türk S, Pauskar M, Jõgeda EL, Šunina M, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Avi R, Lutsar I. Med Microbiol Immunol. 2016 Jun;205(3):231-9. doi: 10.1007/s00430-015-0444-8. Epub 2015 Dec 22. PMID: 26696529 Non-fatal overdoses and related risk factors among people who inject drugs in St. Petersburg, 44. Russia and Kohtla-Järve, Estonia. Uusküla A, Raag M, Vorobjov S, Rüütel K, Lyubimova A, Levina OS, Heimer R. BMC Public Health. 2015 Dec 18;15:1255. doi: 10.1186/s12889-015-2604-6. PMID: 26684815 Free PMC article. Changes in chlamydia control activities in Europe between 2007 and 2012: a cross-national 45. survey. van den Broek IV, Sfetcu O, van der Sande MA, Andersen B, Herrmann B, Ward H, Götz HM, Uusküla A, Woodhall SC, Redmond SM, Amato-Gauci AJ, Low N, van Bergen JE. Eur J Public Health. 2016 Jun;26(3):382-8. doi: 10.1093/eurpub/ckv196. Epub 2015 Oct 24. PMID: 26498953 Free PMC article. Comparison of subset selection methods in linear regression in the context of health-related 46. quality of life and substance abuse in Russia. Morozova O, Levina O, Uusküla A, Heimer R. BMC Med Res Methodol. 2015 Aug 30;15:71. doi: 10.1186/s12874-015-0066-2. PMID: 26319135 Free PMC article. An international perspective on using opioid substitution treatment to improve hepatitis C 47. prevention and care for people who inject drugs: Structural barriers and public health potential. Perlman DC, Jordan AE, Uuskula A, Huong DT, Masson CL, Schackman BR, Des Jarlais DC. Int J Drug Policy. 2015 Nov;26(11):1056-63. doi: 10.1016/j.drugpo.2015.04.015. Epub 2015 Apr 27. PMID: 26050614 Free PMC article. Internalized HIV and Drug Stigmas: Interacting Forces Threatening Health Status and Health 48. Service Utilization Among People with HIV Who Inject Drugs in St. Petersburg, Russia. Calabrese SK, Burke SE, Dovidio JF, Levina OS, Uusküla A, Niccolai LM, Heimer R. 18  AIDS Behav. 2016 Jan;20(1):85-97. doi: 10.1007/s10461-015-1100-4. PMID: 26050155 Free PMC article. Behavioral Interventions to Reduce Sexual Risk Behavior in Adults with HIV/AIDS Receiving 49. HIV Care: A Systematic Review. Laisaar KT, Raag M, Rosenthal M, Uusküla A. AIDS Patient Care STDS. 2015 May;29(5):288-98. doi: 10.1089/apc.2014.0240. Epub 2015 Apr 6. PMID: 25844941 Free PMC article. Review. A tale of two cities: stigma and health outcomes among people with HIV who inject drugs in St. 50. Petersburg, Russia and Kohtla-Järve, Estonia. Burke SE, Calabrese SK, Dovidio JF, Levina OS, Uusküla A, Niccolai LM, Abel-Ollo K, Heimer R. Soc Sci Med. 2015 Apr;130:154-61. doi: 10.1016/j.socscimed.2015.02.018. Epub 2015 Feb 16. PMID: 25703668 Free PMC article. HIV research productivity and structural factors associated with HIV research output in 51. European Union countries: a bibliometric analysis. Uusküla A, Toompere K, Laisaar KT, Rosenthal M, Pürjer ML, Knellwolf A, Läärä E, Des Jarlais DC. BMJ Open. 2015 Feb 3;5(2):e006591. doi: 10.1136/bmjopen-2014-006591. PMID: 25649212 Free PMC article. Genital chlamydia prevalence in Europe and non-European high income countries: systematic 52. review and meta-analysis. Redmond SM, Alexander-Kisslig K, Woodhall SC, van den Broek IV, van Bergen J, Ward H, Uusküla A, Herrmann B, Andersen B, Götz HM, Sfetcu O, Low N. PLoS One. 2015 Jan 23;10(1):e0115753. doi: 10.1371/journal.pone.0115753. eCollection 2015. PMID: 25615574 Free PMC article. Review. Influence of interleukin 10 polymorphisms -592 and -1082 to the HIV, HBV and HCV serostatus 53. among intravenous drug users. Kallas E, Huik K, Pauskar M, Jõgeda EL, Karki T, Des Jarlais D, Uusküla A, Avi R, Lutsar I. Infect Genet Evol. 2015 Mar;30:175-180. doi: 10.1016/j.meegid.2014.12.023. Epub 2014 Dec 24. PMID: 25542814 HIV testing and counselling in Estonian prisons, 2012 to 2013: aims, processes and impacts. 54. Kivimets K, Uuskula A. Euro Surveill. 2014 Nov 27;19(47):20970. doi: 10.2807/1560-7917.es2014.19.47.20970. PMID: 25443037 Provision of chlamydia testing, and training of primary health care staff about chlamydia 55. testing, across four European countries. Uusküla A, Ricketts EJ, Rugman C, Kalda RR, Fredlund H, Hedlund J, Dunais B, Touboul PP, McNulty C. BMC Public Health. 2014 Nov 5;14:1147. doi: 10.1186/1471-2458-14-1147. PMID: 25374092 Free PMC article. Adherence to antiretroviral medications among persons who inject drugs in transitional, low 56. and middle income countries: an international systematic review. Feelemyer J, Des Jarlais D, Arasteh K, Uusküla A. AIDS Behav. 2015 Apr;19(4):575-83. doi: 10.1007/s10461-014-0928-3. PMID: 25331268 Free PMC article. Review. Self-reported testing, HIV status and associated risk behaviours among people who inject drugs 57. in Europe: important differences between East and West. Uusküla A, Raag M, Folch C, Prasad L, Karnite A, van Veen MG, Eritsyan K, Rosinska M, Des Jarlais DC, Wiessing L. AIDS. 2014 Jul 17;28(11):1657-64. doi: 10.1097/QAD.0000000000000299. PMID: 25232900 The incidence of hip fractures in Estonia, 2005-2012. 58. Jürisson M, Vorobjov S, Kallikorm R, Lember M, Uusküla A. Osteoporos Int. 2015 Jan;26(1):77-84. doi: 10.1007/s00198-014-2820-4. Epub 2014 Aug 15. 19  PMID: 25182229 The prevalence of genital warts in the Baltic countries: findings from national cross-sectional 59. surveys in Estonia, Latvia and Lithuania. Uusküla A, Reile R, Rezeberga D, Karnite A, Logminiene Z, Padaiga Ž, Nygård M. Sex Transm Infect. 2015 Feb;91(1):55-60. doi: 10.1136/sextrans-2014-051540. Epub 2014 Aug 7. PMID: 25104496 Combined prevention for persons who inject drugs in the HIV epidemic in a transitional 60. country: the case of Tallinn, Estonia. Uusküla A, Des Jarlais DC, Raag M, Pinkerton SD, Feelemyer J. AIDS Care. 2015;27(1):105-11. doi: 10.1080/09540121.2014.940271. Epub 2014 Jul 23. PMID: 25054646 Free PMC article. Disseminated giant hyperkeratotic porokeratosis and treatment with acitretin: a case report. 61. Uusküla A, Erm T. Acta Derm Venereol. 2015 Feb;95(2):241-2. doi: 10.2340/00015555-1908. PMID: 24923352 No abstract available. Non-cancer morbidity among Estonian Chernobyl cleanup workers: a register-based cohort 62. study. Rahu K, Bromet EJ, Hakulinen T, Auvinen A, Uusküla A, Rahu M. BMJ Open. 2014 May 14;4(5):e004516. doi: 10.1136/bmjopen-2013-004516. PMID: 24833681 Free PMC article. The HIV epidemic in Eastern Europe and Central Asia. 63. DeHovitz J, Uuskula A, El-Bassel N. Curr HIV/AIDS Rep. 2014 Jun;11(2):168-76. doi: 10.1007/s11904-014-0202-3. PMID: 24652411 Association between HIV-1 tropism and CCR5 human haplotype E in a Caucasian population. 64. Huik K, Avi R, Uibopuu H, Pauskar M, Margus T, Karki T, Krispin T, Kool P, Rüütel K, Talu A, Abel-Ollo K, Uusküla A, Carrillo A, He W, Ahuja SK, Lutsar I. J Acquir Immune Defic Syndr. 2014 Jul 1;66(3):239-44. doi: 10.1097/QAI.0000000000000127. PMID: 24508837 Free PMC article. Prevalence of IGRA-positivity and risk factors for tuberculosis among injecting drug users in 65. Estonia and Latvia. Rüütel K, Karnite A, Talu A, Abel-Ollo K, Kirvelaite G, Kliiman K, Loit HM, Uusküla A. Int J Drug Policy. 2014 Jan;25(1):175-8. doi: 10.1016/j.drugpo.2013.10.002. Epub 2013 Oct 16. PMID: 24210296 Association between TLR3 rs3775291 and resistance to HIV among highly exposed Caucasian 66. intravenous drug users. Huik K, Avi R, Pauskar M, Kallas E, Jõgeda EL, Karki T, Marsh K, Des Jarlais D, Uusküla A, Lutsar I. Infect Genet Evol. 2013 Dec;20:78-82. doi: 10.1016/j.meegid.2013.08.008. Epub 2013 Aug 17. PMID: 23962581 Free PMC article. CCR5 haplotypes influence HCV serostatus in Caucasian intravenous drug users. 67. Huik K, Avi R, Carrillo A, Harper N, Pauskar M, Sadam M, Karki T, Krispin T, Kongo UK, Jermilova T, Rüütel K, Talu A, Abel-Ollo K, Uusküla A, Ahuja SK, He W, Lutsar I. PLoS One. 2013 Jul 25;8(7):e70561. doi: 10.1371/journal.pone.0070561. Print 2013. PMID: 23936229 Free PMC article. Non-fatal injuries resulting in activity limitations in Estonia--risk factors and association with 68. the incidence of chronic conditions and quality of life: a retrospective study among the population aged 20-79. Puur A, Altmets K, Saava A, Uusküla A, Sakkeus L. BMJ Open. 2013 Jul 30;3(7):e002695. doi: 10.1136/bmjopen-2013-002695. PMID: 23901024 Free PMC article. 30 Years on Selected Issues in the Prevention of HIV among Persons Who Inject Drugs. 69. Des Jarlais DC, Pinkerton S, Hagan H, Guardino V, Feelemyer J, Cooper H, Hatzatkis A, Uuskula A. Adv Prev Med. 2013;2013:346372. doi: 10.1155/2013/346372. Epub 2013 Jun 12. 20  PMID: 23840957 Free PMC article. The epidemiological and economic impact of a quadrivalent human papillomavirus (hpv) 70. vaccine in Estonia. Uusküla A, Müürsepp A, Kawai K, Raag M, Jürisson M, Pillsbury M. BMC Infect Dis. 2013 Jul 3;13:304. doi: 10.1186/1471-2334-13-304. PMID: 23819789 Free PMC article. Is the HCV-HIV co-infection prevalence amongst injecting drug users a marker for the level of 71. sexual and injection related HIV transmission? Vickerman P, Martin NK, Roy A, Beattie T, Jarlais DD, Strathdee S, Wiessing L, Hickman M; EMCDDA Collaborative Group. Drug Alcohol Depend. 2013 Sep 1;132(1-2):172-81. doi: 10.1016/j.drugalcdep.2013.01.020. Epub 2013 Feb 28. PMID: 23453261 Incidence of cervical intraepithelial neoplasia in Estonia. 72. Uusküla A, Raag M, Uppin A, Raud T, Klaar U, Jürisson M, Müürsepp A. J Low Genit Tract Dis. 2013 Apr;17(2):129-36. doi: 10.1097/LGT.0b013e3182652213. PMID: 23422640 Developing an adherence support intervention for patients on antiretroviral therapy in the 73. context of the recent IDU-driven HIV/AIDS epidemic in Estonia. Laisaar KT, Uusküla A, Sharma A, DeHovitz JA, Amico KR. AIDS Care. 2013;25(7):863-73. doi: 10.1080/09540121.2013.764393. Epub 2013 Feb 7. PMID: 23391132 Free PMC article. Clinical Trial. A decline in the prevalence of injecting drug users in Estonia, 2005-2009. 74. Uusküla A, Rajaleid K, Talu A, Abel-Ollo K, Des Jarlais DC. Int J Drug Policy. 2013 Jul;24(4):312-8. doi: 10.1016/j.drugpo.2012.11.002. Epub 2013 Jan 3. PMID: 23290632 Free PMC article. Socio-demographic factors, health risks and harms associated with early initiation of injection 75. among people who inject drugs in Tallinn, Estonia: evidence from cross-sectional surveys. Vorobjov S, Des Jarlais DC, Abel-Ollo K, Talu A, Rüütel K, Uusküla A. Int J Drug Policy. 2013 Mar;24(2):150-5. doi: 10.1016/j.drugpo.2012.08.003. Epub 2012 Oct 1. PMID: 23036651 Free PMC article. Years of potential life lost due to HIV infection and associated factors based on national HIV 76. surveillance data in Latvia, 1991-2010. Karnite A, Brigis G, Uuskula A. Scand J Infect Dis. 2013 Feb;45(2):140-6. doi: 10.3109/00365548.2012.717710. Epub 2012 Sep 19. PMID: 22992136 Changes in high-risk sexual behaviour among Estonian adults between 1996 and 2006. 77. Liivlaid H, Uusküla A. Sex Transm Infect. 2013 Mar;89(2):91-7. doi: 10.1136/sextrans-2012-050506. Epub 2012 Sep 8. PMID: 22962070 Antiretroviral therapy (ART) adherence and correlates to nonadherence among people on ART 78. in Estonia. Uusküla A, Laisaar KT, Raag M, Šmidt J, Semjonova S, Kogan J, Amico KR, Sharma A, Dehovitz J. AIDS Care. 2012;24(12):1470-9. doi: 10.1080/09540121.2012.672724. Epub 2012 Apr 25. PMID: 22533736 Multiple routes of drug administration and HIV risk among injecting drug users. 79. Vorobjov S, Uusküla A, Des Jarlais DC, Abel-Ollo K, Talu A, Rüütel K. J Subst Abuse Treat. 2012 Jun;42(4):413-20. doi: 10.1016/j.jsat.2011.09.014. Epub 2011 Nov 23. PMID: 22116012 Free PMC article. Condom use and partnership intimacy among drug injectors and their sexual partners in 80. Estonia. Uusküla A, Abel-Ollo K, Markina A, McNutt LA, Heimer R. 21  Sex Transm Infect. 2012 Feb;88(1):58-62. doi: 10.1136/sextrans-2011-050195. Epub 2011 Nov 4. PMID: 22056984 Risk for Heterosexual HIV Transmission Among Non-Injecting Female Partners of Injection 81. Drug Users in Estonia. Uusküla A, McMahon JM, Kals M, Talu A, Abel-Ollo K, Rüütel K, Des Jarlais DC. AIDS Behav. 2013 Mar;17(3):879-88. doi: 10.1007/s10461-011-0078-9. PMID: 22038080 Expanded syringe exchange programs and reduced HIV infection among new injection drug 82. users in Tallinn, Estonia. Uusküla A, Des Jarlais DC, Kals M, Rüütel K, Abel-Ollo K, Talu A, Sobolev I. BMC Public Health. 2011 Jun 30;11:517. doi: 10.1186/1471-2458-11-517. PMID: 21718469 Free PMC article. Enhanced tuberculosis case detection among substitution treatment patients: a randomized 83. controlled trial. Rüütel K, Loit HM, Sepp T, Kliiman K, McNutt LA, Uusküla A. BMC Res Notes. 2011 Jun 15;4:192. doi: 10.1186/1756-0500-4-192. PMID: 21676222 Free PMC article. Estonia at the threshold of the fourth decade of the AIDS era in Europe. 84. Laisaar KT, Avi R, DeHovitz J, Uusküla A. AIDS Res Hum Retroviruses. 2011 Aug;27(8):841-51. doi: 10.1089/aid.2010.0223. Epub 2011 Jan 11. PMID: 21142588 Free PMC article. Emergent properties of HIV risk among injection drug users in Tallinn, Estonia: synthesis of 85. individual and neighbourhood-level factors. Uusküla A, McMahon JM, Raag M, Silm S, Rüütel K, Talu A, Abel-Ollo K, Ahas R, Des Jarlais DC. Sex Transm Infect. 2010 Dec;86 Suppl 3:iii79-84. doi: 10.1136/sti.2009.040212. PMID: 21098060 European surveillance of antimicrobial resistance in Neisseria gonorrhoeae. 86. Cole MJ, Chisholm SA, Hoffmann S, Stary A, Lowndes CM, Ison CA; European Surveillance of Sexually Transmitted Infections Network. Sex Transm Infect. 2010 Nov;86(6):427-32. doi: 10.1136/sti.2010.044164. PMID: 20940154 Assessing non-response to a mailed health survey including self-collection of biological 87. material. Uusküla A, Kals M, McNutt LA. Eur J Public Health. 2011 Aug;21(4):538-42. doi: 10.1093/eurpub/ckq053. Epub 2010 May 10. PMID: 20457781 Free PMC article. Population-based type-specific prevalence of high-risk human papillomavirus infection in 88. Estonia. Uusküla A, Kals M, Kosenkranius L, McNutt LA, DeHovitz J J. BMC Infect Dis. 2010 Mar 11;10:63. doi: 10.1186/1471-2334-10-63. PMID: 20222944 Free PMC article. Trends in the epidemiology of bacterial sexually transmitted infections in eastern Europe, 89. 1995-2005. Uusküla A, Puur A, Toompere K, DeHovitz J. Sex Transm Infect. 2010 Feb;86(1):6-14. doi: 10.1136/sti.2009.037044. PMID: 20157177 Review. Evaluating recruitment among female sex workers and injecting drug users at risk for HIV using 90. respondent-driven sampling in Estonia. Uusküla A, Johnston LG, Raag M, Trummal A, Talu A, Des Jarlais DC. J Urban Health. 2010 Mar;87(2):304-317. doi: 10.1007/s11524-009-9427-7. Epub 2010 Feb 4. PMID: 20131018 Free PMC article. Self-reported activity limitations among the population aged 20-79 in Estonia: a cross-sectional 91. study. 22  Altmets K, Puur A, Uusküla A, Saava A, Sakkeus L, Katus K. Eur J Public Health. 2011 Feb;21(1):49-55. doi: 10.1093/eurpub/ckp239. Epub 2010 Feb 3. PMID: 20129929 Free PMC article. CCL3L1 copy number is a strong genetic determinant of HIV seropositivity in Caucasian 92. intravenous drug users. Huik K, Sadam M, Karki T, Avi R, Krispin T, Paap P, Rüütel K, Uusküla A, Talu A, Abel-Ollo K, Lutsar I. J Infect Dis. 2010 Mar;201(5):730-9. doi: 10.1086/650491. PMID: 20095832 Free PMC article. Knowledge of HIV serostatus and risk behaviour among injecting drug users in Estonia. 93. Abel-Ollo K, Rahu M, Rajaleid K, Talu A, Ruutel K, Platt L, Bobrova N, Rhodes T, Uuskula A. AIDS Care. 2009 Jul;21(7):851-7. doi: 10.1080/09540120802657522. PMID: 20024741 Lymphogranuloma venereum in Europe, 2003-2008. 94. Savage EJ, van de Laar MJ, Gallay A, van der Sande M, Hamouda O, Sasse A, Hoffmann S, Diez M, Borrego MJ, Lowndes CM, Ison C; European Surveillance of Sexually Transmitted Infections (ESSTI) network. Euro Surveill. 2009 Dec 3;14(48):19428. doi: 10.2807/ese.14.48.19428-en. PMID: 20003898 Syphilis and gonorrhoea in men who have sex with men: a European overview. 95. Savage EJ, Hughes G, Ison C, Lowndes CM; European Surveillance of Sexually Transmitted Infections network. Euro Surveill. 2009 Nov 26;14(47):19417. doi: 10.2807/ese.14.47.19417-en. PMID: 19941803 Should pharmacists have a role in harm reduction services for IDUs? A qualitative study in 96. Tallinn, Estonia. Vorobjov S, Uusküla A, Abel-Ollo K, Talu A, Jarlais DD. J Urban Health. 2009 Nov;86(6):918-28. doi: 10.1007/s11524-009-9400-5. Epub 2009 Nov 18. PMID: 19921542 Free PMC article. Informed recruitment in partner studies of HIV transmission: an ethical issue in couples 97. research. McNutt LA, Gordon EJ, Uusküla A. BMC Med Ethics. 2009 Aug 27;10:14. doi: 10.1186/1472-6939-10-14. PMID: 19709442 Free PMC article. The trends and risk factors for hepatitis B occurrence in Estonia. 98. Paat G, Uusküla A, Tefanova V, Tallo T, Priimägi L, Ahi K. Cent Eur J Public Health. 2009 Jun;17(2):108-11. doi: 10.21101/cejph.a3483. PMID: 19662830 Factors influencing quality of life of people living with HIV in Estonia: a cross-sectional survey. 99. Rüütel K, Pisarev H, Loit HM, Uusküla A. J Int AIDS Soc. 2009 Jul 16;12:13. doi: 10.1186/1758-2652-12-13. PMID: 19607721 Free PMC article. HIV infection and risk behaviour of primary fentanyl and amphetamine injectors in Tallinn, 100. Estonia: implications for intervention. Talu A, Rajaleid K, Abel-Ollo K, Rüütel K, Rahu M, Rhodes T, Platt L, Bobrova N, Uusküla A. Int J Drug Policy. 2010 Jan;21(1):56-63. doi: 10.1016/j.drugpo.2009.02.007. Epub 2009 Apr 22. PMID: 19395249 Comparison of injecting drug users who obtain syringes from pharmacies and syringe exchange 101. programs in Tallinn, Estonia. Vorobjov S, Uusküla A, Abel-Ollo K, Talu A, Rüütel K, Des Jarlais DC. Harm Reduct J. 2009 Feb 20;6:3. doi: 10.1186/1477-7517-6-3. PMID: 19232088 Free PMC article. Quality of life of people living with HIV and AIDS in Estonia. 102. Rüütel K, Uusküla A, Minossenko A, Loit HM. Cent Eur J Public Health. 2008 Sep;16(3):111-5. doi: 10.21101/cejph.a3461. 23  PMID: 18935773 The prevalence of chlamydial infection in Estonia: a population-based survey. 103. Uusküla A, Kals M, Denks K, Nurm U, Kasesalu L, Dehovitz J, McNutt LA. Int J STD AIDS. 2008 Jul;19(7):455-8. doi: 10.1258/ijsa.2008.007325. PMID: 18574116 Free PMC article. High-prevalence and high-estimated incidence of HIV infection among new injecting drug users 104. in Estonia: need for large scale prevention programs. Uusküla A, Kals M, Rajaleid K, Abel K, Talu A, Rüütel K, Platt L, Rhodes T, Dehovitz J, Des Jarlais D. J Public Health (Oxf). 2008 Jun;30(2):119-25. doi: 10.1093/pubmed/fdn014. Epub 2008 Feb 28. PMID: 18308743 Free PMC article. A study on HIV and hepatitis C virus among commercial sex workers in Tallinn. 105. Uusküla A, Fischer K, Raudne R, Kilgi H, Krylov R, Salminen M, Brummer-Korvenkontio H, St Lawrence J, Aral S. Sex Transm Infect. 2008 Jun;84(3):189-91. doi: 10.1136/sti.2007.027664. Epub 2008 Feb 6. PMID: 18256109 The HIV prevention needs of injection drug users in Estonia. 106. Wilson TE, Sharma A, Zilmer K, Kalikova N, Uusküla A. Int J STD AIDS. 2007 Jun;18(6):389-91. doi: 10.1258/095646207781024900. PMID: 17609027 Free PMC article. High prevalence of blood-borne virus infections and high-risk behaviour among injecting drug 107. users in Tallinn, Estonia. Uusküla A, McNutt LA, Dehovitz J, Fischer K, Heimer R. Int J STD AIDS. 2007 Jan;18(1):41-6. doi: 10.1258/095646207779949907. PMID: 17326862 Free PMC article. High HIV prevalence among injecting drug users in Estonia: implications for understanding the 108. risk environment. Platt L, Bobrova N, Rhodes T, Uusküla A, Parry JV, Rüütel K, Talu A, Abel K, Rajaleid K, Judd A. AIDS. 2006 Oct 24;20(16):2120-3. doi: 10.1097/01.aids.0000247586.23696.20. PMID: 17053361 Barriers to effective STI screening in a post-Soviet society: results from a qualitative study. 109. Uusküla A, Kangur K, McNutt LA. Sex Transm Infect. 2006 Aug;82(4):323-6. doi: 10.1136/sti.2005.019000. PMID: 16877585 Free PMC article. Sex work in Tallinn, Estonia: the sociospatial penetration of sex work into society. 110. Aral SO, St Lawrence JS, Uusküla A. Sex Transm Infect. 2006 Oct;82(5):348-53. doi: 10.1136/sti.2006.020677. Epub 2006 Jun 28. PMID: 16807288 Free PMC article. HIV epidemic in Estonia in the third decade of the AIDS era. 111. Rüütel K, Uusküla A. Scand J Infect Dis. 2006;38(3):181-6. doi: 10.1080/00365540500388743. PMID: 16507499 Review. Surveillance of HIV, hepatitis B virus, and hepatitis C virus in an estonian injection drug-using 112. population: sensitivity and specificity of testing syringes for public health surveillance. Uuskula A, Heimer R, Dehovitz J, Fischer K, McNutt LA. J Infect Dis. 2006 Feb 1;193(3):455-7. doi: 10.1086/499436. Epub 2005 Dec 22. PMID: 16388495 Free PMC article. Laboratory diagnosis of sexually transmitted infections in estonia in 2001-2002: shortcomings 113. with impact on diagnostic quality and surveillance. Naaber P, Uusküla A, Naaber J, Põder A, Hjelm E, Hallén A, Unemo M, Domeika M. Sex Transm Dis. 2005 Dec;32(12):759-64. doi: 10.1097/01.olq.0000175381.26082.fc. PMID: 16314773 The burden of infection with herpes simplex virus type 1 and type 2: seroprevalence study in 114. Estonia. 24  Uusküla A, Nygard-Kibur M, Cowan FM, Mayaud P, French RS, Robinson JN, Brown DW. Scand J Infect Dis. 2004;36(10):727-32. doi: 10.1080/00365540410020992. PMID: 15513398 Syphilis as a social disease: experience from the post-communist transition period in Estonia. 115. Uusküla A, Nygård JF, Kibur-Nygård M. Int J STD AIDS. 2004 Oct;15(10):662-8. doi: 10.1177/095646240401501006. PMID: 15479502 Free PMC article. Treatment of sexually transmitted diseases in Estonia: consistency with the evidence-based 116. medicine principles. Uusküla A, McNutt LA, Dehovitz J. Sex Transm Dis. 2004 Oct;31(10):631-5. doi: 10.1097/01.olq.0000140022.34441.e3. PMID: 15389004 Atypical genital herpes: report of five cases. 117. Uusküla A, Raukas E. Scand J Infect Dis. 2004;36(1):37-9. doi: 10.1080/00365540310017276. PMID: 15000557 Free PMC article. Seroepidemiological study of herpes simplex virus types 1 and 2 in Brazil, Estonia, India, 118. Morocco, and Sri Lanka. Cowan FM, French RS, Mayaud P, Gopal R, Robinson NJ, de Oliveira SA, Faillace T, Uusküla A, Nygård-Kibur M, Ramalingam S, Sridharan G, El Aouad R, Alami K, Rbai M, Sunil-Chandra NP, Brown DW. Sex Transm Infect. 2003 Aug;79(4):286-90. doi: 10.1136/sti.79.4.286. PMID: 12902576 Free PMC article. The role of injection drug use in the emergence of Human Immunodeficiency Virus infection in 119. Estonia. Uusküla A, Kalikova A, Zilmer K, Tammai L, DeHovitz J. Int J Infect Dis. 2002 Mar;6(1):23-7. doi: 10.1016/s1201-9712(02)90131-1. PMID: 12044297 Genital mycoplasmas, including Mycoplasma genitalium, as sexually transmitted agents. 120. Uusküla A, Kohl PK. Int J STD AIDS. 2002 Feb;13(2):79-85. doi: 10.1258/0956462021924695. PMID: 11839161 Review. A case-control study of beliefs and behaviors associated with sexually transmitted disease 121. occurrence in Estonia. Wilson TE, Uusküla A, Feldman J, Holman S, Dehovitz J. Sex Transm Dis. 2001 Nov;28(11):624-9. doi: 10.1097/00007435-200111000-00003. PMID: 11677383 Sexually transmitted infections in Estonia--syndromic management of urethritis in a European 122. country? Uusküla A, Plank T, Lassus A, Bingham JS. Int J STD AIDS. 2001 Aug;12(8):493-8. doi: 10.1258/0956462011923570. PMID: 11487388 Review. Sexually transmitted diseases in Estonia: past and present. 123. Uusküla A, Silm H, Vessin T. Int J STD AIDS. 1997 Jul;8(7):446-50. doi: 10.1258/0956462971920505. PMID: 9228592 LISA 2. Ajakirjas Eesti arst publitseeritud tööd 1. Uusküla A. Epidemioloogia – mis see on? Eesti Arst 2019; 98(4):243–245 2. Uusküla A. Ajas muutuvad eesmärgid. Eesti Arst 2013; 92(5):244–246. 3. Saava A, Puur A, Altmets K, Sakkeus L, Uusküla A. Toimetulekupiiranguid põhjustanud vigastused Eestis: rahvastikupõhine sündmuslooline uuring. Eesti Arst 2011; 90(4):165−173. 25  4. Anderson, Eva; Toompere, Karolin; Reile, Rainer; Uusküla, Anneli (2013). Naiste teadlikkus emakakaelavähki ennetavatest meetmetest Eestis 2011. aastal. Eesti Arst, 92 (4), 195−203. 5. Uusküla A, Jürisson J, Kallikorm R, Võrk A. Sõeluuringu rakendamise põhjendatus osteoporoosi varaseks diagnoosimiseks Eestis. Eesti Arst 2009; 88(6):402−413. 6. Uusküla A. HIV/AIDSi ennetus – erinevate meetmete rakendamise tõhususe analüüs. Eesti Arst 2009; 88(4):250−256. 7. Rüütel K, Uusküla A. HIV-nakkuse leviku trendid maailmas. Eesti Arst 2009; 88(4):246−249. 8. Altmets K, Katus K, Puur A, Saava A, Uusküla A. Toimetulekupiirangud Eesti täisealises rahvastikus – levimus ja tegelik abistamine. Eesti Arst 2008; 87(2):92−101. 9. Uusküla A, Silm H. Genitaalsed mükoplasma infektsioonid. Eesti Arst 2000;5: 282-6. 10. Põder A, Uusküla A. Gonorröa ravi Unasyniga. Eesti Arst 1997; 5: 413-5. 11. Uusküla A, Silm H, Põder A, Kivi H, Vaher R. Komplitseerumata gonorröa ravi ühekordse spektinomütsiini annusega. Eesti Arst 1996; 4: 300-2. 12. Silm H, Karelson M, Kaur S, Rajangu H, Rannala-Lille T, Vahlberg A, Pärna E. Uusküla A. Fucicort dermatoloogias. Eesti Arst 1996; 3: 223-6. 13. Kaur S, Silm H, Kangur A, Uusküla A, Karelson M. FIBROLAN-lahus ja -salv haavandite ravis. Eesti Arst 1996; 2: 124-7. 14. Kaur S, Uusküla A, Vindireviskih G, Silm H. Süüfilise diagnoosimise tõhustamise vajalikkus ja võimalused Eestis. Eesti Arst 1995; 5: 396-9. 15. Silm H, Elberg E, Kaur S, Rajangu H, Uusküla A. Lokaalselt kasutatavad D-vitamiini derivaadid psoriaasi ravis. Eesti Arst 1994; 4: 297-9. Lisa 2. Kasutatud kirjanduse nimistu Booth A, Reed AB, Ponzo S, Yassaee A, Aral M, Plans D, Labrique A, Mohan D. Population risk factors for severe disease and mortality in COVID-19: A global systematic review and meta-analysis. PLoS One. 2021 Mar 4;16(3):e0247461. doi: 10.1371/journal.pone.0247461. Shi Q, Wang Z, Liu J, Wang X, Zhou Q, Li Q, Yu Y, Luo Z, Liu E, Chen Y; COVID-19 evidence and recommendations working group. Risk factors for poor prognosis in children and adolescents with COVID- 19: A systematic review and meta-analysis. EClinicalMedicine. 2021 Nov;41:101155. doi: 10.1016/j.eclinm.2021.101155. Epub 2021 Oct 19. Harder T, Külper-Schiek W, Reda S, Treskova-Schwarzbach M, Koch J, Vygen-Bonnet S, Wichmann O. Effectiveness of COVID-19 vaccines against SARS-CoV-2 infection with the Delta (B.1.617.2) variant: second interim results of a living systematic review and meta-analysis, 1 January to 25 August 2021. Euro Surveill. 2021 Oct;26(41):2100920. doi: 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.41.2100920. Melissa M Higdon, Brian Wahl, Carli B Jones, Joseph G Rosen, Shaun A Truelove, Anurima Baidya, Anjalika A Nande, Parisa A ShamaeiZadeh, Karoline K Walter, Daniel R Feikin, Minal K Patel, Maria Deloria Knoll, Alison L Hill. A systematic review of COVID-19 vaccine efficacy and effectiveness against SARS-CoV-2 infection and disease. medRxiv 2021.09.17.21263549; doi: https://doi.org/10.1101/2021.09.17.21263549 Sotoodeh Ghorbani S, Taherpour N, Bayat S, Ghajari H, Mohseni P, Hashemi Nazari SS. Epidemiologic characteristics of cases with reinfection, recurrence, and hospital readmission due to COVID-19: A systematic review and meta-analysis. J Med Virol. 2022 Jan;94(1):44-53. doi: 10.1002/jmv.27281. Mukherjee, A., Anand, T., Agarwal, A., Singh, H., Chatterjee, P., Narayan, J., . . . Panda, S. (2021). SARS- CoV-2 re-infection: Development of an epidemiological definition from India. Epidemiology and Infection, 149, E82. doi:10.1017/S0950268821000662 26 Lisa 3. 27  EESTI BIOEETIKA JA INIMUURINGUTE NÕUKOGU OTSUS 14 . detsember 2021 nr 1.1-12/ 3788 Nõukogu koosseisus: Esimees: Liina Vahter – Tallinna Ülikool Aseesimees: Aime Keis – Tartu Ülikooli inimuuringute eetika komitee Teadussekretär: Aive Pevkur – Tallinna Tehnikaülikool Liikmed: Agne Velthut-Meikas – Tallinna Tehnikaülikool Kärt Salumaa-Lepik, Tallinna Tehnikaülikool Ingeri Luik-Tamme – TGS Baltic Advokaadibüroo Meego Remmel – Eesti Kirikute Nõukogu Maie Bachmann – Tallinna Tehnikaülikool Pärt Peterson – Tartu Ülikool Kristjan Kask – Tallinna Ülikool Merike Sisask – Tallinna Ülikoool Arutas 14 . detsembril 2021 . a vastutava uurija Anneli Uusküla , Tart u Ülikooli professor i uuringu „ COVID-19 haigusjuhtumite analüüs ja riskirühmade väljaselgitamine Eestis “ ta otlus t. Uuringu eesmärgiks on Eestis SARS-Cov-2 nakatunute haigestumise, haiguse kulu tõsidusastm ete ja nakkuse tervisetagajärgede süsteemne analüüs, mis võimaldab teha i nformeeritud otsuseid tulevaste nakkuspuhangute korral ja arendab tervise/administratiiv andm ete kasutamist meditsiiniliseks otsusetoeks, rahvatervise seireks, tervise teenuste planeerimis eks ning meetmete efektiivsuse, põhjendatuse analüüsiks. Uuringu taotluse menetlusest taandas ennast Maarja Kirss, Andmekaitse Inspektsioonist. Otsus: a nda luba uuringu läbiviimiseks, kui taotluses: parandatakse uuringu alguse kuupäev; punktis 11 esitatakse valimi kirjeldus . Uuringu läbiviimise lõpptähtaeg on 31. märts 2027 . a. Otsuse lahutamatu lisa d on vastutava uurija Anneli Uusküla poolt 23 . novembri l 2021 . a allkirjastatud uuringu taotlus. /allkirjastatud digitaalselt/ Liina Vahter Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogu esimees Tartu Ülikooli inimuuringute eetika komitee Protokolli number: 351/M-8 koosolek: 18.10.2021 Komitee koosseis: Esimees Aime Keis Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, meditsiinieetika nooremlektor Aseesimees Kristi Lõuk Tartu Ülikool, humanitaarteaduste ja kunstide valdkond, projektijuht / doktorant Liikmed Diva Eensoo Tervise Arengu Instituut, analüütik Katrin Kaarna Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, kliiniliste teadusuuringute üksuse tegevjuht Kalle Kisand Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, laborimeditsiini professor Piret Koosa Eesti Rahva Muuseum, teadur Malle Kuum Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, farmakoloogia lektor / farmakoloogia teadur Marje Oona Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, peremeditsiini kaasprofessor / kliinilise meditsiini instituudi täienduskeskuse juhataja Maire Peters Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, geneetika kaasprofessor Atko Sulhan-Remmel Tartu Ülikool, humanitaarteaduste ja kunstide valdkond, religiooniuuringute kaasprofessor Anna-Liisa Tamm Tartu Tervishoiu Kõrgkool, füsioteraapia ja tervisekaitse osakonna juhataja Otsus: Kooskõlastada uurimistöö jätkamine Uurimistöö nimetus: COVID-19 haigusjuhtumite analüüs ja riskirühmade väljaselgitamine Eestis Vastutavad uurijad (asutused): Anneli Uusküla (Tartu Ülikool, meditsiiniteaduste valdkond, peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut, Ravila 19, Tartu) Komitee poolt läbivaadatud dokumendid: 1. Jätkutaotluse kaaskiri 2. Muudatustega uurimistöö avaldus kooskõlastuse saamiseks Tartu Ülikool inimuuringute eetika komiteelt Uurimistöö lõpp: 31.03.2027 Komitee esimees: Aime Keis /allkirjastatud digitaalselt/ Komitee sekretär: Kaire Kallak /allkirjastatud digitaalselt/ ________________________________________________________________________________ Tartu Ülikool tel 737 6215 grandikeskus e-post [email protected] Raekoja plats 9 www.ut.ee/teadus/eetikakomitee 51004 Tartu Väljastatud: /viimase digitaalallkirja kuupäev/ 2  Andmepäringu vorm Andmepäringu esitava isiku kontaktandmed: Eesnimi: Anneli Perekonnanimi: Uusküla Isikukood: 46704112783 Telefoninumber: 7374195 E-posti aadress: [email protected] Kui tegemist on päringuga asutuse või organisatsiooni nimel, siis selle asutuse andmed: Asutuse nimi ja registrikood: Tartu Ülikool, 74001073 Aadress: Ülikooli 18, 50090 TARTU Andmete töötlemise eesmärk: Andmeid kasutame RITA tegevus 1: Strateegilise TA tegevuse toetusest rahastatud projekti (RITA1/02-120) eesmärkide täitmiseks. Esitame päringu seoses uuringuga „COVID-19 haigusjuhtumite analüüs ja riskirühmade väljaselgitamine Eestis“ Uuringu eesmärgiks on Eestis SARS-Cov-2 nakatunute haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgede süsteemne analüüs, mis võimaldab teha informeeritud otsuseid tulevaste nakkuspuhangute korral ja arendab tervise/administratiiv andmete kasutamist meditsiiniliseks otsusetoeks, rahvatervise seireks, tervise teenuste planeerimiseks ning meetmete efektiivsuse, põhjendatuse analüüsiks. (https://tervis.ut.ee/et/teadus/uuringumeeskond) Uuringu põhimõtteline disain ja küsimused on esitletud all oleval joonisel. Uuringu projekti on kooskõlastanud (i) TÜ inimuuringute eetikakomitee (Protokolli number: 351/M-8, koosolek: 18.10.2021). TÜ inimuuringute eetikakomitee on kooskõlastanud uuringu läbiviimise korra (sh Terviseameti, Eesti Haigekassa, Rahvastiku ning surma põhjuste registri andmete kasutuse); ja (ii) Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogu (Otsus 14. detsember 2021 nr 1.1-12/3788) Terviseinfosüsteemist andmete taotluseks. Andmete saamise soovitav tähtaeg: Projekti tellijaks on Sotsiaalministeerium koostöös Haridus- ja teadusministeeriumiga ning eesmärgiks kirjeldada Covid-19 haigusest ja selle raskest kulust enamohustatud rahvastiku rühmi. Selline info on üks olulistest sisenditest poliitiliste ja tervishoiu korralduslike otsuste tegemisel. Projekti plaanimisel (kevad 2020) jäi vajaliku tähelepanuta Covid-19 vaktsineerimine ja selle mõju haigestumisele, haiguse raskusele. Praeguseks on selge, et vaktsineerimise andmeid (vaktsineeritust) arvestamata ei ole võimalik sisuka ja Eesti jaoks kohandatud riskikalkulaatori välja töötamine. Projekti RITA1/02-120 lõppraporti esitamise tähtaeg on 21.03.2022.a. Oleme väga tänulikud, kui teil on võimalik meie andmepäringut menetleda kiirkorras. Oluliseks abiks on ka vaid vaktsineeritusega seotud andmete esmajärjekorras väljastamine. Päringu teostamiseks vajaliku täpsusega valimi tingimus: Soovime valimisse kuuluvate isikute Covid-19 testimisega ja Covid-19 vaktsineerimisega seotud andmeid. Valimisse kuulub kokku 438 433 uuritavad (isikud, kel SARS-CoV-2 positiivne RNA test n= 66 295 või kliiniline Covid-19 diagnoos n= 24 053; ning ilma COVID-19 diagnoosita kontrollisikud n= 348 885). Päringu teostamiseks esitame teile valimisse kuuluvate uuritavate isikukoodid. Periood, mille kohta andmeid saada soovitakse: Käesolev taotlus on seotud andmete väljavõtuga perioodist 26.02.2020 kuni päringuks andmete väljavõtu kuupäevani. Projektis jälgitakse Covid-19 haigestunute ja neile sobitatud kontrollisikuid kuni märtsini 2027. Soovitavate andmete koosseis: 1. Isikukood 2. Immuniseerimise andmed 2.1. Immuniseerimise kuupäev 2.2. Mille vastu immuniseeriti (ainult Covid-19 immuniseerimise andmed) 2.3. Immuniseerimisel manustatud annus ja preparaat (2.3.1. Immunpreparaadi ATC kood ja toimeaine(te) nimetus(ed); 2.3.2. Immuunpreparaadi nimetus; 2.3.3. Partii number; 2.3.4. Manustatud annus; 2.3.5. Manustamise kordsus) 2.4. Immuniseerimise kuuri andmed (2.4.1. Järgmise immuniseerimise kuupäev; 2.4.2. Märge immuniseerimise lõpetamise kohta) 3. Covid-19 testimise andmed 3.1 SARS-CoV-2 RNA testimise andmed: SARS-CoV-2 analüüsiks proovi võtmise kuupäev/kuu/aasta; testi teostamise kuupäev/kuu/aasta; testi tulemus; positiivse SARS-CoV-2 testi puhul registreeritud oletatav nakatumise koht 3.2. SARS-CoV-2 (Covid-19) seroloogilise (antikehade) testimise andmed: analüüsiks proovi võtmise kuupäev/kuu/aasta; testimiseks kasutatud testi tüüp/tootja; teostamise kuupäev/kuu/aasta; testi tulemus (millised antikehad, kvantitatiivne, kvalitatiivne tulemus, ühikud). Päritud andmeid soovime CSV formaadis. Lugupidamisega Anneli Uusküla Peremeditsiini ja rahvatervishoiu instituut, professor Tartu Ülikool 21. detsember 2021.a.  Anneli Uusküla Tartu Ülikooli peremeditsiini ja rahvatervishoiu Teie 17.01.2022 / instituut Meie 02.02.2022 nr 1.5-20/442-1 [email protected] [email protected] Vastutava töötleja luba Lugupeetud Olete edastanud taotluse (Lisa 1) andmete väljastamiseks tervise infosüsteemist eesmärgiga läbi viia teadusuuring: „COVID-19 haigusjuhtumite analüüs ja riskirühmade väljaselgitamine Eestis“. Praeguseks on teaduskirjanduses avaldatud uuringud Covid-19 nakatumise ja raske haiguse kulu riski analüüsidest, kirjeldatud erinevate vaktsiinide efektiivsust ning korduvate nakatumiste riski valitud rahvastikurühmades (tervishoiutöötajad, hooldekodude elanikud, leibkondade uuringud) (Booth 2021; Shi 2021; Harder 2021; Higdon 2021). Jätkuvalt on vajalik teave haigestumise/korduvahaigestumise kulu (sh haiguse raskuse), riski ning seotud tegurite kohta kogu rahvastikupõhistest uuringutest (sh laste hulgas ja eakatel). Kogutud andmeid kasutatakse COVID-19 juhtude haigestumise/korduva haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgede analüüsiks ning haigestumise/korduva haigestumise, haiguse kulu ja kaugtagajärgedega seotud tegurite välja selgitamiseks ning riski(prognoosivate) mudelite välja töötamiseks. Lisaks hindamine COVID-19 haigestumise/korduva haigestumise, haiguse kulu tõsidusastmete ja nakkuse tervisetagajärgi esialgu uuringusse kaasatud nakkusevabadel isikutel (326460 kontroll isikut, kellel perioodil 25.02.2020.a. kuni 28.02.2021 positiivsetSARS-CoV-2 RNA testi ei olnud). Uuringul on suur teaduslik väärtus, kuna tekkiv rahvastiku põhine/üle-eestiline valim vaba uuringusse valikulise kaasamisega (nt ainult haiglaravi saanute põhine valim) seotud kallutatusest. Ühtlasi võimaldab uuring analüüsida tegureid, mis võivad mõjutada haigestumise, haiglaravi vajaduse ja surma riski. Sellise tõenduse loomine Eesti jaoks on võimalik ainult kasutades kohalikke andmeid ja on aluseks haigestumise riski stratifitseerimiseks. Enam ohustatud rahvastikurühmade välja selgitamine on oluline ennetavate meetmete (informeerimine, shielding) prioriseerimiseks. Uurija leiavad, et projekti teaduslikel eesmärkidel on ülekaalukas avalik huvi ja see teenib ühiskonna huve. Uuringu käigus hindame esinduslikel rahvusvahelistel kohortidel välja töötatud riski hindamise mudeleid nii täpsuse kui ka rakendatavuse osas, eesmärgiga luua riiklikel tervise/administratiivandmetel põhinev varane tõsist haigusekulgu prognoosiv riskikalkulaator. Tulemusi saab kasutada ka COVID-19 haiguskoormuse ja ennetavate meetmed efektiivsuse hindamise modelleerimisel eelduste informeerimiseks. Kasutades Eesti andmeid tagame, et väljatöötatav riskimudel on õpitud võimalikult laiapõhjalisel andmestikul, kuid võtab arvesse ka Eesti eripärasid. Uuringu projekti on kooskõlastanud ja loa on andnud sõltumatu Eesti Bioeetika ja Inimuuringute Nõukogu (Otsus 14. detsember 2021 nr 1.1-12/3788) (Lisa 2) ning Suur-Ameerika 1 / 10122 Tallinn / 626 9301 / [email protected] / www.sm.ee / registrikood 70001952  2 kooskõlastuse TÜ inimuuringute eetikakomitee (Protokolli number: 351/M-8, koosolek: 18.10.2021) (Lisa 3). Uuringu valim moodustati COVID-19 haigusjuhtudest ning Eestis elavate kontrollidest. Juhud - ajavahemikus 25.02.2020 kuni 28.02.2021 SARS-CoV-2 positiivse RNA testi ja/või Covid- 19 haiguse kliinilise diagnoosi saanud isikud; Kontrollid – ajavahemikus 25.02.2020 kuni 28.02.2021 COVID-19 diagnoosita Eestis isikud, identifitseeritud Haigekassast kindlustatute nimistust juhuvalimi alusel – iga juhu kohta neli kontrolli kasutades tihedusvalikut (density sampling). Soovite valimisse kuuluvate isikute Covid-19 testimisega ja Covid-19 vaktsineerimisega seotud andmeid. Valimisse kuulub kokku 438 433 uuritavat (isikud, kel SARS-CoV-2 positiivne RNA test n= 66 295 või kliiniline Covid-19 diagnoos n= 24 053; ning ilma COVID-19 diagnoosita kontrollisikud n= 348 885). Päringu teostamiseks esitate TEHIKule krüpteeritult valimisse kuuluvate uuritavate isikukoodid ja perioodi, mille kohta andmeid saada soovite: väljavõtuga perioodist 26.02.2020 kuni päringuks andmete väljavõtu kuupäevani. Andmeväljastus toimub vähemalt kord aastas. Projektis jälgitakse Covid-19 haigestunute ja neile sobitatud kontrollisikuid kuni 31. märtsini 2027. Esialgses päringus soovitavate andmete koosseis on toodud Lisas 1. Olete andmevajadust täpsustanud ning vastavalt Lisale 4 märgime, et soovitud andmeid SARS-CoV-2 testi puhul registreeritud oletatava nakatumise koha ning seroloogilise (antikehade) testimise kohta tervise infosüsteemis puuduvad. Tervise infosüsteemi andmed edastatakse teile ja kasutatakse valimi linkimisel pseudonümiseeritult. Andmete edastus ja käitlus toimub igas etapis kõiki andmekaitsereegleid ja infoturbenõudeid järgides. Andmeid säilitatakse Tartu Ülikooli serverites kuni projekti lõpuni, andmetele ligipääs on piiratud ligipääsuparoolidega. Andmeid käideldakse andmete depseudonüümimist ning isikute tuvastamist välistaval viisil. Pseudonüümitud andmetabelit säilitatakse Tartu Ülikooli serveris projekti lõppemiseni (kuni 31. märts 2027) ning seejärel andmed hävitatakse. Lähtuvalt isikuandmete kaitse seaduse § 6 lõigetest 3 ja 4 ning tuginedes Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogu 14. detsembri 2021 otsusele nr 1.1-12/3788 (lisa 2) ning Tartu Ülikooli inimuuringute eetika komitee 18. oktoobri 2021 kooskõlastusele, protokoll nr 351/M-8 (lisa 3), annab Sotsiaalministeerium nõusoleku taotluses viidatud ning täpsustatud (lisa 2 ja 4) andmete väljastamiseks tervise infosüsteemist. Sisendandmeid saadab Tartu Ülikool krüpteeritult TEHIKU asutusepõhisele sertifikaadile (registrikood 70009770), aadressile [email protected]. Andmed väljastab TEHIK Tartu Ülikoolile nende olemasolul ning juhul kui andmed on masinloetavalt tervise infosüsteemi sisestatud. Andmed väljastatakse turvalist andmevahetust tagaval viisil vastutava uurija Anneli Uusküla nimele (isikukood 46704112783) csv failidena TEHIKu poolt nimetatud turvalises keskkonnas. Tehnilistes küsimustes on kontaktisikuteks TEHIKus Terje Lasn [email protected] ja Tartu Ülikoolis Anneli Uusküla [email protected] . Lugupidamisega (allkirjastatud digitaalselt) Maarjo Mändmaa kantsler  3 Lisa: 1. Lisa 1 Taotlus/päring tervise infosüsteemist andmete väljastamiseks 2. Lisa 2 Eesti Bioeetika ja Inimuuringute Nõukogu 14. detsembri 2021 otsus nr 1.1- 12/3788 3. Lisa 3 Tartu Ülikooli inimuuringute eetika komitee 18. oktoobri 2021 kooskõlastus protokoll nr 351/M-8 4. Lisa 4 täpsustatud andmekoosseis Lisaadressaadid: Tervise ja Heaolu Infosüsteemide Keskus Raili Sillart 6269 747 [email protected]  COLUMN_NAME DATA_TYPE NULLABE DATA_DEFAULT PERSONAL_IDENTIFICATION_CODE VARCHAR2(64 BYTE) Yes PERSONAL_IDENTIFICATION_CODE_OID VARCHAR2(200 BYTE) Yes DOCUMENT_NR VARCHAR2(256 BYTE) Yes DOCUMENT_NR_OID VARCHAR2(256 BYTE) Yes DOCUMENT_VRS NUMBER(38,0) Yes DOCUMENT_CREATION_TIME DATE Yes INSTIT_REG_CODE NUMBER(38,0) Yes DOCUMENT_INSERT_TIME TIMESTAMP(6) Yes FIRST_INSERT_TIME TIMESTAMP(6) Yes DOCTOR_REGISTRY_CODE VARCHAR2(40 BYTE) Yes TARGET_DISEASE_CODE VARCHAR2(10 BYTE) Yes TARGET_DISEASE VARCHAR2(64 BYTE) Yes VACCINE_SUBSTANCE_CODE VARCHAR2(10 BYTE) Yes VACCINE_SUBSTANCE VARCHAR2(100 BYTE) Yes DATE_OF_VACCINATION DATE Yes VACCINATION_STATUS VARCHAR2(64 BYTE) Yes VACCINATION_STATUS_VALID NUMBER(1,0) Yes VACCINATION_STATUS_REASON VARCHAR2(128 BYTE) Yes VACCINATION_SERIES NUMBER(10,0) Yes DOSE_NUMBER NUMBER(10,0) Yes DOSE_VALUE VARCHAR2(20 BYTE) Yes DOSE_UNIT VARCHAR2(10 BYTE) Yes BATCH_NUMBER VARCHAR2(256 BYTE) Yes VACCINE VARCHAR2(256 BYTE) Yes NEXT_VACCINATION_DATE DATE Yes PROJECTED_NEXT_VACCINATION_DATE DATE Yes SUGGESTED_NEXT_VACCINATION_SERIES_DATE DATE Yes IS_MEASUREMENT_TYPE_VACCINATED NUMBER(1,0) Yes IS_MEASUREMENT_TYPE_FULLY_VACCINATED NUMBER(1,0) Yes IS_MEASUREMENT_TYPE_DOSES_ADMINISTEREDNUMBER(1,0) Yes CASE_VACCINATION_RANK NUMBER(10,0) Yes PROVIDER_REG_CODE VARCHAR2(20 BYTE) Yes PROVIDER_SERVICE_TYPE VARCHAR2(40 BYTE) Yes PROVIDER_NAME VARCHAR2(245 BYTE) Yes VACCINATION_DOCTOR_FIRST_NAME VARCHAR2(100 BYTE) Yes VACCINATION_DOCTOR_LAST_NAME VARCHAR2(100 BYTE) Yes Inimese kohta PATIENT_GENDER VARCHAR2(20 BYTE) Yes PATIENT_BIRTH_DATE DATE Yes PATIENT_AGE NUMBER(10,0) Yes PATIENT_COUNTRY VARCHAR2(32 BYTE) Yes PATIENT_COUNTRY_EHAK VARCHAR2(5 BYTE) Yes PATIENT_COUNTY VARCHAR2(64 BYTE) Yes PATIENT_COUNTY_EHAK VARCHAR2(5 BYTE) Yes PATIENT_COMMUNE VARCHAR2(64 BYTE) Yes PATIENT_COMMUNE_EHAK VARCHAR2(5 BYTE) Yes PATIENT_VILLAGE VARCHAR2(64 BYTE) Yes PATIENT_VILLAGE_EHAK VARCHAR2(5 BYTE) Yes PATIENT_LOCATION_CODE NUMBER(38,0) Yes PATIENT_LOCATION_EHAK VARCHAR2(5 BYTE) Yes PATIENT_LOCATION_VALID NUMBER(1,0) Yes COLUMN_ID andmevälja selgitus 2 isikukood või patsiendi kood 3 Isikukoodi või patsiendi koodi klassifikaatori OID, näitab mis riigi isiku koodiga tegu 8 immuniseerimise teatise number Immuniseerimise teatise dokumendi numbri OID näitab, millise TTO-ga on tegemist ning seega tagab OID tervise infosüsteemi tasandil numbri unikaalsuse, kui igas 9 TTO-s on nummerdamisega unikaalsus tagatud. 10 dokumendi versioon 11 dokumendi kinnitamise aeg asutuses 12 dokumendi eest vastuatava asutuse Äriregsitri koodi 14 aeg, mil dokument tervise infosüsteemi vastu võeti 15 aeg, mil dokument tervise infosüsteemi esimest korda vastu võeti 17 Tervishoiutöötaja registreerimistõendi numbe 20 haigus, mille vastu immuniseeriti, kood 21 haigus, mille vastu immuniseeriti nimetus 22 ATC kood 23 toimeaine nimetus 24 vaksineerimise kuupäev 25 vaktsineerimise staatus 26 kas vaktsineerimise staatus kehtib 27 vaksineerimise staatuse ärireegel 28 vaktsineerimise kuur 29 manustamise kordsus 30 doosi annus 31 doosi mõõtühik 32 partii nr 33 vaktsiini nimetus 35 järgmine immuniseerimise aeg dokumendilt 36 järgmise immuniseerimise aeg vastavalt ärireeglitele 37 tõhustusdoosi aeg vastavalt ärireeglitele 38 kas on vaktsineeritud vähemalt 1 kord 39 kas on täielikult vaksineeritud 40 manustatud dooside arv 41 loendus, mitmes vaktsineerimine on aegreas 56 Vaksineerimise teinud asutuse Äriregsitri kood 57 Vaktsineerimise teinud asutuse teenuseosutaja tüüp 64 Vaksineerimise teinud asutuse nimetus 66 vaksineerija eesnimi 67 vaksineerija perekonna nimi 42 43 44 45 46 47 48 49 50 51 52 53 54 55 alsuse, kui igas COLUMN_NAME DATA_TYPE NULLABE DATA_DEFAULT COLUMN_ID PERSONAL_IDENTIFICATION_CODE VARCHAR2(64 BYTE) Yes 2 PERSONAL_IDENTIFICATION_CODE_OIDVARCHAR2(200 BYTE) Yes 3 RESULT_TYPE VARCHAR2(32 BYTE) Yes 6 RESULT_VALUE VARCHAR2(4 BYTE) Yes 7 RESULT_TIME DATE Yes 8 INSTIT_REG_CODE_NAME VARCHAR2(255 BYTE) Yes 14 CUSTODIAN_REGISTRY_CODE_NAME VARCHAR2(255 BYTE) Yes 15 CLINICAL_DOC_ID VARCHAR2(200 BYTE) Yes CLINICAL_DOC_ID_OID VARCHAR2(255 BYTE) Yes PROC_CODE VARCHAR2(20 BYTE) Yes PROC_CODE_OID VARCHAR2(255 BYTE) Yes Inimese kohta PATIENT_GENDER VARCHAR2(2 BYTE) Yes 16 PATIENT_AGE NUMBER(10,0) Yes 17 PATIENT_AGE_GROUP VARCHAR2(16 BYTE) Yes 18 PATIENT_COUNTRY VARCHAR2(64 BYTE) Yes 19 PATIENT_COUNTRY_EHAK VARCHAR2(10 BYTE) Yes 20 PATIENT_COUNTY VARCHAR2(256 BYTE) Yes 21 PATIENT_COUNTY_EHAK VARCHAR2(10 BYTE) Yes 22 PATIENT_COMMUNE VARCHAR2(256 BYTE) Yes 23 PATIENT_COMMUNE_EHAK VARCHAR2(10 BYTE) Yes 24 PATIENT_VILLAGE VARCHAR2(256 BYTE) Yes 25 PATIENT_VILLAGE_EHAK VARCHAR2(10 BYTE) Yes 26 PATIENT_LOCATION_EHAK VARCHAR2(10 BYTE) Yes 27 PATIENT_BIRTH_DATE DATE Yes 33 andmevälja selgitus isikukood või patsiendi kood Isikukoodi või patsiendi koodi klassifikaatori OID, näitab mis riigi isiku koodiga tegu tingilik jaotus, et mis tüüpi proovimaterjaliga v testiga tegu ( nt ninaneelukaape RNA, kurguloputusvedeliku RNA jne) SARS-CoV-2 analüüsitulemuse vastus Testi tegemise analüüsitulemuse aeg ISO 8601 standardi vormingus koos ajavööndiga dokumendi eest vastutava astuse Äriregsitri kood dokumendi eest vastutava astuse nimetus dokumendi nr dokumendi nr OID ehk klassifikaator näitab, millise asutusega on tegemist analüüsi kood analüüsi koodi klassifikaator, antud juhul on klassifiakatoriks LOINC koodistik oputusvedeliku RNA jne) Kood Nimetus Pikk Tulemus Kasutamise algus - lõpp nimetus RNA analüüsid 94309-2 SARS koroonaviirus 2 SARS N/P 13.03.2020 RNA koroonaviir us 2 RNA A-5509 SARS koroonaviirus 2 SARS N/Pp/P 25.05.2021 (06.08.2021 ei RNA (seireuuring) koroonaviir ole veel TIS-i laekunud) us 2 RNA L-5422 SARS koroonaviirus 2 SARS N/Pp/P 11.11.2020 RNA (ise kogutud) koroonaviir us 2 RNA kurguloputu svedelikust (ise kogutud) SARS N/P 03.03.2020 - SARS koroonaviirus 2 A-5427 koroonaviir kehtetu alates aprillist RNA us 2 RNA Antigeeni analüüsid 94558-4 SARS koroonaviirus 2 SARS N/P 05.11.2020 Ag (ribaanalüüs) koroonaviir us 2 antigeen täpsustama ta materjalis (ribaanalüü s) 96119-3 SARS koroonaviirus 2 SARS N/P 15.01.2021 Ag koroonaviir us 2 Ag täpsustama ta materjalis Proovimaterjal ninaneelukaabe kurguloputusvedelik ninaneelukaabe (kurguloputusvedelik) kurguloputusvedelik ninaneelukaabe ninakeelukaabe ninakeelukaabe