Lp. Katrin Reinhold
Tervise ja Heaolu Infosüsteemide Keskus
Sotsiaalministeerium 08.04.2020, nr 3-10/GI/10590-2
Uus-Tatari 25 10134 Tallinn
[email protected]
Tartu Ülikooli genoomika instituudi pöördumine
Austatud Katrin Reinhold
Käesolevaga pöördub Tartu Ülikool, registrikood 74001073 Teie poole seoses TÜ genoomika instituudi
(GI) poolt planeeritava uurimistööga ”Ülegenoomne assotsiatsiooni analüüs SARS-CoV-2 (Severe Acute
Respiratory Syndrome Coronavirus 2) infektsiooniga kaasnevate fenotüüpide mõistmiseks”.
Uuringu eesmärk on viia läbi ülegenoomne assotsiatsiooni analüüs, et mõista kas ja kuidas on SARS-CoV-
2 viiruse põhjustatud COVID-19 (Coronavirus Disease 2019) nakatumise tõenäosus ning nakatumisega
kaasuvad terviseprobleemid mõjutatud inimese geneetikast. Saadud infot kasutatakse rahvusvahelises
biopankade koostöö raames läbiviidavas metaanalüüsis. See uuring aitab kaasa haiguse geneetilise tausta
mõistmisele ning annab sisendit farmaatsiafirmadele uute ravimikandidaatide leidmiseks.
GI on esitanud taotluse Eesti bioeetika ja inimuuringute nõukogule kooskõlastuse saamiseks. Loodame
selle saada lähipäevil. Taotluses on kirjeldatud soovi saada andmeid tervise infosüsteemist ja
nakkushaiguste registrist. Uurimistööd iseloomustab aegkriitilisus ja geenidoonorite terviseandmete
operatiivse saamise vajadus nimetatud andmebaasidest.
Pöördumise eesmärk on kooskõlastada andmete linkimise koosseis ja sagedus.
GI soov on tervise infosüsteemist saada geenidoonorite kohta andmeid järgmise sagedusega:
1. SARS-CoV-2 testimise ja testi tulemuse info üks kord nädalas,
2. Tavapärase GI-tervise infosüsteemi linkimise käigus saadav andmekoosseis kahenädalase
intervalliga.
Tavapärase linkimise andmekoosseis on järgmine:
1) ambulatoorne epikriis;
2) statsionaarne epikriis;
3) saatekiri;
4) saatekirja vastus;
10) immuniseerimise teatis.
Nimetatud andmete täpne koosseis on toodud Sotsiaalministri määruse nr. 53 lisades nr. 1-4 ja 10 (* Tervise
infosüsteemi edastatavate dokumentide andmekoosseisud ning nende säilitamise tingimused ja kord, kehtiv
redaktsioon RT I, 06.03.2020, 17, 41 jõustumise kpv. 09.03.2020).
Soovime Teie hinnangut, kas on otstarbekas lisada veel mõne lisa koososeisu kuuluv teave - näiteks Lisa
28, Nakkushaiguse teatise andmekoosseis - või on see informatsioon kaetud eespool nimetatud lisadega?
Ülikooli 18, 50090 Tartu | 737 5100 |
[email protected] | www.ut.ee | Registrikood 74001073
Lisaks soovime Teie seisukohta nakkushaiguste registrist andmete pärimise kohta. Eeldame, et sellest
registrist on võimalik saada andmeid nakatumise kohta operatiivsemalt ja struktureeritud kujul, mis
lihtsustaks ja kiirendaks andmete analüüsimist.
TEHIKule väljastatakse andmete linkimiseks ca 200 000 geenidoonori andmed. Viiruse testimise tulemusi
on hetkeseisuga eeldatavalt 3000-4000 geenidoonori kohta (see arv sõltub Eestis teostatud testimiste
üldarvust ja kasvab ajas).
Taust
TÜ GI Eesti geenivaramu (EGV) andmete kogumine algas 2002. aastal ning käesolevalt on EGV-s 200 000
eestimaalase andmed. EGV andmekogu põhjal tehtavad uuringud on jätkuvad ega ole piiratud käesoleva
aja teaduse tasemega. EGV tegevus näeb ette kogutud andmete uuendamist, täiendamist ja kontrollimist
teistest andmebaasidest ning vajadusel ka andmete parandamist. Ilma laia ja võimalikult täpse
fenotüübiandmestikuta ei ole võimalik usaldusväärselt hinnata geenide rolli haiguste kujunemisel ja seega
ei saa täita EGV-le seadusega pandud eesmärke (edendada geeniuuringute arengut, koguda teavet Eesti
rahvastiku tervise ja pärilikkuse informatsiooni kohta ning rakendada geeniuuringute tulemused rahva
tervise parandamiseks).
Seaduslik tagapõhi
EGV tegevust reguleerib inimgeeniuuringute seadus (IGUS), mis on vastu võetud 13.12.2000, RT I 2000,
104, 685 (praegu kehtiva redaktsiooni jõustumise kuupäev 15.03.2019). IGUS §24 lõike 2 punkt 3 sätestab,
et depseudonüümimine on lubatud geenidoonori terviseseisundi kirjelduse uuendamiseks, täiendamiseks
või kontrollimiseks ilma geenidoonoriga ühendust võtmata, kui geenidoonor ei ole keelanud andmete
täiendamist, uuendamist või kontrollimist. Antud juhul oleme lähtunud asjaolust, et soovime andmeid saada
konkreetse uurimistöö läbiviimiseks küllalt sageli kuni epideemia vaibumiseni ning sel põhjusel taotleme
ka eetikakomitee kooskõlastust.
Lugupidamisega
Mait Metspalu
TÜ Genoomika instituudi direktor
(allkirjastatud digitaalselt)
2 (2)